Fosfopentoosiepimeraasi

Fosfopentoosiepimeraasi eli ribuloosifosfaatti-3-epimeraasi on entsyymi, joka katalysoi ribuloosi-5-fosfaatin reversiibeliä isomeroitumista epimeerikseen ksyluloosi-5-fosfaatiksi. Entsyymi osallistuu pentoosifosfaattireittiin ja Calvinin kiertoon osana fotosynteesiä.[1] Fosfopentoosiepimeraasin EC-numero on EC 5.1.3.1.[2]

Malli riisin (Oryza sativa) fosfopentoosiepimeraasin rakenteesta

ToimintaMuokkaa

Rakenteeltaan fosfopentoosiepimeraasi on useimmiten dimeeri ja esimerkiksi ihmisen entsyymin molekyylipaino on 45 kDa.[2] Toimiakseen entsyymi vaatii kofaktorikseen useimmiten joko rauta- tai sinkki-ionin.[2][3] Fosfopentoosiepimeraasin mekanismi musituttaa fosfopentoosi-isomeraasin mekanismia siten, että molemmissa ensimmäinen vaihe on happaman protonin vastaanottaminen hiileltä ja enediolivälituotteen muodostuminen. Fosfopentoosiepimeraasin katalysoimassa pentoosifosfaattireitin reaktiossa välituotteena muodostuu 2,3-enedioli, kun aktiivisen kohdan aspartaatti-muodossa oleva asparagiinihappo vastaanottaa protonin ribuloosi-5-fosfaatin C3-hiiliatomilta. Tämän jälkeen toinen asparagiinihappo luovuttaa protonin C3-hiilelle, jolloin tapahtuu stereokemian inversio ja muodostuu ribuloosi-5-fosfaatin epimeeri ksyluloosi-5-fosfaatti. Calvinin kierrossa fosfopentoosiepimeraasi katalysoi vastakkaissuntaista reaktiota eli ksyluloosi-5-fosfaatin isomeroitumista ribuloosi-5-fosfaatiksi.[1][3]

LähteetMuokkaa

  1. a b Jeremy M. Berg, John L. Tymoczko & Lubert Stryer: Biochemistry, 6th Edition, s. 571, 580. W. H. Freeman and Company, 2006. ISBN 978-0-7167-8724-2. (englanniksi)
  2. a b c EC 5.1.3.1 - ribulose-phosphate 3-epimerase Brenda. Viitattu 03.03.2013. (englanniksi)
  3. a b John McMurry,Tadhg P. Begley: The organic chemistry of biological pathways, s. 207. Roberts and Company Publishers, 2005. ISBN 978-0974707716. Kirja Googlen teoshaussa (viitattu 07.03.2013). (englanniksi)
Tämä biologiaan liittyvä artikkeli on tynkä. Voit auttaa Wikipediaa laajentamalla artikkelia.