Fosfopentoosi-isomeraasi

Malli Escherichia coli -bakteerin fosfopentoosi-isomeraasin rakenteesta.

Fosfopentoosi-isomeraasi eli riboosi-5-fosfaatti-isomeraasi on entsyymi, joka katalysoi ribuloosi-5-fosfaatin ja riboosi-5-fosfaatin välistä isomeroitumisreaktiota. Entsyymi osallistuu pentoosifosfaattireittiin ja osana fotosynteesiä tapahtuvaa Calvinin kiertoa.[1] Fosfopentoosi-isomerasin EC-numero on EC 5.3.1.6.[2]

ToimintaMuokkaa

Rakenteeltaan fosfopentoosi-isomeraasi on dimeeri.[2] Entsyymin katalysoima isomeroituminen tapahtuu 1,2-enediolivälivaiheen kautta. Pentoosifosfaattireitissä tämä muodostuu ribuloosi-5-fosfaatista, siten, että entsyymin aktiivisen kohdan glutamiinihappo on glutamaattimuodossa ja ottaa vastaa protonin C1-asemassa sijaitsevalta hiileltä ja tämän jälkeen asparagiinihappo luovuttaa protonin C2-hiileen liittyneelle happiatomille. Yhden protonin vastaanottamisen ja yhden protonin luovuttamisen jälkeen muodostuu 1,2-enediolivälituotteesta riboosi-5-fosfaatti.[3][4] 

Calvinin kierrossa fosfopentoosi-isomeraasi katalysoi riboosi-5-fosfaatin muuntumista ribuloosi-5-fosfaatiksi. Mekanismi on käänteinen pentoosifosfaattireitissä tapahtuvaan isomeroitumisreaktioon verrattuna.[3]

LähteetMuokkaa

  1. Jeremy M. Berg, John L. Tymoczko & Lubert Stryer: Biochemistry, 6th Edition. W. H. Freeman and Company, 2006. ISBN 978-0-7167-8724-2. (englanniksi)
  2. a b EC 5.3.1.6 - Ribose-5-phosphate isomerase Brenda. Viitattu 3.3.2013. (englanniksi)
  3. a b John McMurry, Tadhg P. Begley: The organic chemistry of biological pathways, s. 207. Roberts and Company Publishers, 2005. ISBN 978-0974707716. Kirja Googlen teoshaussa (viitattu 3.3.2013). (englanniksi)
  4. Herbert J. Fromm, Mark Hargrove: Essentials of Biochemistry, s. 199. Springer, 2012. ISBN 978-3-642-19624-9. Kirja Googlen teoshaussa (viitattu 3.3.2013). (englanniksi)
Tämä biologiaan liittyvä artikkeli on tynkä. Voit auttaa Wikipediaa laajentamalla artikkelia.