Ero sivun ”Neuraminidaasi” versioiden välillä

Poistettu sisältö Lisätty sisältö

Inline

Versio 28. lokakuuta 2009 kello 18.49

Neuraminidaasit eli sialidaasit ovat glykosidihydrolaasientsyymejä, jotka halkaisevat neuramiinihappojen glykosidisidoksia. Neuraminidaasientsyymejä on paljon ja niitä esiintyy monissa organismeissa. Yleisesti tunnetuin neuraminidaasi on virusten pinnan neuraminidaasi, joka on influenssainfektiolääkkeiden kohde. Influenssavirusten pinnalta löytyviä neuraminidaaseja käytetään usein antigeenideterminantteina eli epitooppeina. Jotkut influenssavirusten neuraminidaasit antavat virukselle enemmän virulenssia kuin toiset neuraminidaasit. Nisäkässolujen neuraminidaaseilla on monia tehtäviä. Ainakin neljä nisäkäsneuraminidaasihomologia on kuvattu ihmisen genomissa.

Neuraminidaasit katalysoivat vastavalmistuneiden virionien ja isäntäsolun reseptorien terminaalisten sialihappotähteiden hydrolyysiä.^[2] Neuraminidaasien aktiviteetteihin kuuluvat viruspartikkeleiden kulkeutumisen avustaminen hengitysteiden liman läpi ja virionin tuottamien jälkeläisten poistumisen avustaminen infektoituneesta solusta.^[3]^[4]

Reaktio

On olemassa kaksi neuraminidaasipääluokkaa, jotka halkaisevat joko ekso- tai endopolysiaalihappoja:

Terminaalisten sialihappotähteiden α-(2→3)-, α-(2→6)-, α-(2→8)-glykosidisidosten eksohydrolyysi^[5]^[6]
Oligo- tai poly(siaali)happojen (2→8)-α-sialosyylisidosten endohydrolyysi^[6]

Alatyypit

Swiss-Prot listasi 18. lokakuuta vuonna 2006 137 neuraminidaasityyppiä eri lajeista. Influenssaneuraminidaaseista tunnetaan yhdeksän alatyyppiä; kaikkia yhdeksää alatyyppiä löydetään yleisesti lintujen influenssaviruksista, mutta nisäkkäiden influenssaviruksista löydetään vain tiettyjä alatyyppejä. Ihmisistä ja sioista löydetään yleisesti vain N1 ja N2 alatyyppejä.^[7] Influenssavirusten eri alatyyppien neuraminidaaseille on ominaista serologisen ristireaktiivisuuden puuttuminen ja noin 50 prosentin aminohapposekvenssihomologia.^[8] Virusten, lintujen ja nisäkkäiden lisäksi neuraminidaaseja on myös bakteereissa, joissa ne ovat tärkeitä patogeenisyyden kannalta.^[9]

Rakenne

Influenssaneuraminidaasi on homotetrameerinen glykoproteiini ja esiintyy sienen muotoisena ohutvartisena projektiona influenssaviruksen pinnalla. Neuraminidaasin kokonaismolekyylipaino on noin 240 kDa, josta sienimäisen pääosan osuus on noin 200 kDa. Ohut varsiosa ankkuroi neuraminidaasin viruksen kalvoon. Molekyylin pää on täysin vastuussa neuraminidaasin entsymaattisesta aktiivisuudesta.^[10]

Katso myös

Lähteet

↑ Bossart-Whitaker P, Carson M, Babu YS, Smith CD, Laver WG, Air GM: Three-dimensional structure of influenza A N9 neuraminidase and its complex with the inhibitor 2-deoxy 2,3-dehydro-N-acetyl neuraminic acid. J Mol Biol, 1993, 232. vsk, nro 4, s. 1069–83. RCSB PDB: Structure Summary. (englanniksi)
↑ von Itzstein M: The war against influenza: discovery and development of sialidase inhibitors. Nature Reviews. Drug Discovery, 2007, 6. vsk, nro 12, s. 967–74. The war against influenza: discovery and development of sialidase inhibitors. (englanniksi)
↑ Palase P, Tobita K, Ueda M, Compans RW: Characterization of temperature sensitive influenza virus mutants defective in neuraminidase. Virology, 1974, 61. vsk, nro 2, s. 397–410. Characterization of temperature sensitive influenza virus mutants defective in neuraminidase. (englanniksi)
↑ Liu C, Eichelberger MC, Compans RW, Air GM: Influenza type A virus neuraminidase does not play a role in viral entry, replication, assembly, or budding. Journal of Virology, 1995, 69. vsk, nro 2, s. 1099–106. Influenza type A virus neuraminidase does not play a role in viral entry, replication, assembly, or budding. (englanniksi)
↑ Schauer R: Chemistry, metabolism, and biological functions of sialic acids. Adv Carbohydr Chem Biochem, 1982, 40. vsk, s. 131–234.
↑ ^a ^b Cabezas JA: Some questions and suggestions on the type references of the official nomenclature (IUB) for sialidase(s) and endosialidase. Biochem J, 1991, 278. vsk, nro Pt 1, s. 311–2. Some questions and suggestions on the type references of the official nomenclature (IUB) for sialidase(s) and endosialidase. (englanniksi)
↑ Sylte MJ, Suarez DL: Influenza neuraminidase as a vaccine antigen. Curr Top Microbiol Immunology, 2009, 333. vsk, s. 227–41. Influenza neuraminidase as a vaccine antigen. (englanniksi)
↑ Baker AT, Varghese JN, Laver WG, Air GM, Colman PM: Three-dimensional structure of neuraminidase of subtype N9 from an avian influenza virus. Proteins, 1987, 2. vsk, nro 2, s. 111–7.
↑ Hsiao YS, Parker D, Ratner AJ, Prince A, Tong L: Crystal structures of respiratory pathogen neuraminidases. Biochem Biophys Res Commun, 2009, 13. vsk, nro 380, s. 467–71. Crystal structures of respiratory pathogen neuraminidases. (englanniksi)
↑ Burmeister WP, Ruigrok RW, Cusack S: The 2.2 A resolution crystal structure of influenza B neuraminidase and its complex with sialic acid. EMBO J, 1992, 11. vsk, nro 1, s. 49–56. The 2.2 A resolution crystal structure of influenza B neuraminidase and its complex with sialic acid. (englanniksi)

Aiheesta muualla

Kuvia neuraminidaaseista

[”Bossart”-1] Bossart-Whitaker P, Carson M, Babu YS, Smith CD, Laver WG, Air GM: Three-dimensional structure of influenza A N9 neuraminidase and its complex with the inhibitor 2-deoxy 2,3-dehydro-N-acetyl neuraminic acid. J Mol Biol, 1993, 232. vsk, nro 4, s. 1069–83. RCSB PDB: Structure Summary. (englanniksi)

[”Itzstein”-2] von Itzstein M: The war against influenza: discovery and development of sialidase inhibitors. Nature Reviews. Drug Discovery, 2007, 6. vsk, nro 12, s. 967–74. The war against influenza: discovery and development of sialidase inhibitors. (englanniksi)

[”Palase”-3] Palase P, Tobita K, Ueda M, Compans RW: Characterization of temperature sensitive influenza virus mutants defective in neuraminidase. Virology, 1974, 61. vsk, nro 2, s. 397–410. Characterization of temperature sensitive influenza virus mutants defective in neuraminidase. (englanniksi)

[”Liu”-4] Liu C, Eichelberger MC, Compans RW, Air GM: Influenza type A virus neuraminidase does not play a role in viral entry, replication, assembly, or budding. Journal of Virology, 1995, 69. vsk, nro 2, s. 1099–106. Influenza type A virus neuraminidase does not play a role in viral entry, replication, assembly, or budding. (englanniksi)

[”Schauer”-5] Schauer R: Chemistry, metabolism, and biological functions of sialic acids. Adv Carbohydr Chem Biochem, 1982, 40. vsk, s. 131–234.

[Cabezas-6] Cabezas JA: Some questions and suggestions on the type references of the official nomenclature (IUB) for sialidase(s) and endosialidase. Biochem J, 1991, 278. vsk, nro Pt 1, s. 311–2. Some questions and suggestions on the type references of the official nomenclature (IUB) for sialidase(s) and endosialidase. (englanniksi)

[”Sylte”-7] Sylte MJ, Suarez DL: Influenza neuraminidase as a vaccine antigen. Curr Top Microbiol Immunology, 2009, 333. vsk, s. 227–41. Influenza neuraminidase as a vaccine antigen. (englanniksi)

[”Baker”-8] Baker AT, Varghese JN, Laver WG, Air GM, Colman PM: Three-dimensional structure of neuraminidase of subtype N9 from an avian influenza virus. Proteins, 1987, 2. vsk, nro 2, s. 111–7.

[”Hsiao”-9] Hsiao YS, Parker D, Ratner AJ, Prince A, Tong L: Crystal structures of respiratory pathogen neuraminidases. Biochem Biophys Res Commun, 2009, 13. vsk, nro 380, s. 467–71. Crystal structures of respiratory pathogen neuraminidases. (englanniksi)

[Burmaister-10] Burmeister WP, Ruigrok RW, Cusack S: The 2.2 A resolution crystal structure of influenza B neuraminidase and its complex with sialic acid. EMBO J, 1992, 11. vsk, nro 1, s. 49–56. The 2.2 A resolution crystal structure of influenza B neuraminidase and its complex with sialic acid. (englanniksi)

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]