Ero sivun ”Genomiselain” versioiden välillä

Poistettu sisältö Lisätty sisältö

Inline

Nykyinen versio 17. kesäkuuta 2020 kello 14.24

Genomiselain (engl. genome browser) on graafinen käyttöliittymä, jolla visualisoidaan genomitietoa. Toisen sukupolven sekvensointimenetelmien kehittymisen myötä genomien sekvensointi lisääntyi ja genomitiedon määrä lähti kasvuun. Genomiselaimet kehitettiin helpottamaan tietokantoihin tallennetun suuren tietomäärän käsittelyä. Ne voivat olla yhdelle lajille spesifisiä tai niillä voidaan visualisoida monen lajin perimä.^[1] Suosituimpia verkkopohjaisia genomiselaimia ovat Ensembl ja UCSC.^[2]

Lähteet muokkaa

↑ Jun Wang, Lei Kong, Ge Gao, Jingchu Luo: A brief introduction to web-based genome browsers. Briefings in Bioinformatics, 2013, 14. vsk, nro 2, s. 131–143. Oxford University Press. doi:10.1093/bib/bbs029. (englanniksi)
↑ Medina, Ignacio ym: Genome Maps, a new generation genome browser. Nucleic Acids Research, 2013, 41. vsk, s. W41–W46. PubMed:23748955. doi:10.1093/nar/gkt530. (englanniksi)

Tämä tietotekniikkaan liittyvä artikkeli on tynkä. Voit auttaa Wikipediaa laajentamalla artikkelia.

[1] Jun Wang, Lei Kong, Ge Gao, Jingchu Luo: A brief introduction to web-based genome browsers. Briefings in Bioinformatics, 2013, 14. vsk, nro 2, s. 131–143. Oxford University Press. doi:10.1093/bib/bbs029. (englanniksi)

[2] Medina, Ignacio ym: Genome Maps, a new generation genome browser. Nucleic Acids Research, 2013, 41. vsk, s. W41–W46. PubMed:23748955. doi:10.1093/nar/gkt530. (englanniksi)

[1]

[2]