Candidatus Carsonella ruddii
Candidatus Carsonella ruddii on endosymbionttinen bakteeri, jonka genomi on pienin kaikista tunnetuista bakteereista. Sillä ei ole monia elämälle välttämättömäksi luokiteltuja geenejä, mikä ehkä viittaa sen ehkä hankkineen organellimaisen elintavan. Sen genomi on vain kolmanneksen parasiittisesti elävän Nanoarchaeum equitansin genomista, joka oli tätä ennen pienin tiedetty genomi. C. ruddiilla on myös paljon suurempi osuus proteiineja ja RNA:ta koodaavaa aluetta genomista, 97.3%, kuin muilla tunnetuilla bakteereilla. Myös DNA:n AT-pitoisuus on huomattavan korkea.[1] C. ruddiilta puuttuvia geenejä ovat esimerkiksi DNA:n kahdentumiseen, transkriptioon ja translaatioon liittyvät geenit sekä kolmen tärkeän aminohapon synteesin geenit.[2]
| Candidatus Carsonella ruddii | |
|---|---|
| Tieteellinen luokittelu | |
| Domeeni: | Bakteerit Bacteria |
| Kunta: | Bakteerit Eubacteria |
| Pääjakso: | Proteobacteria |
| Luokka: | Gammaproteobacteria |
| Heimo: | luokittelematon |
| Suku: | Candidatus Carsonella |
| Laji: | ruddii |
| Kaksiosainen nimi | |
|
Carsonella ruddii |
|
| Katso myös | |
C. ruddii esiintyy endosymbionttina kaikissa nilassa kulkevaa mahlaa syövissä Psyllidae-heimon hyönteisissä.[3][4]
LähteetMuokkaa
- ↑ Nakabachi A, Yamashita A, Toh H, Ishikawa H, Dunbar H, Moran N, Hattori M: The 160-kilobase genome of the bacterial endosymbiont Carsonella. Science, 2006, 314. vsk, nro 5797, s. 267. DOI 10.1126/science.1134196 PMID 17038615. Artikkelin verkkoversio. (englanniksi)
- ↑ Tamames J, Gil R, Latorre A, Peretó J, Silva FJ, Moya A.: The frontier between cell and organelle: genome analysis of Candidatus Carsonella ruddii. BMC Evolutionary Biology, 2007, 7. vsk, nro 181. doi:10.1186/1471-2148-7-181, PMID 17908294. Artikkelin verkkoversio (open access, CC-BY-2.0). Viitattu 21.5.2012. (englanniksi)
- ↑ Thao, ML et al.: Cospeciation of Psyllids and Their Primary Prokaryotic Endosymbionts. Applied and Environmental Microbiology, 2000, 66. vsk, nro 7, s. 2898-2905. doi: 10.1128/AEM.66.7.2898-2905.2000. Artikkelin verkkoversio. Viitattu 21.5.2012. (englanniksi)[vanhentunut linkki]
- ↑ Thao, ML et al.: Phylogenetic analysis of vertically transmitted psyllid endosymbionts (Candidatus Carsonella ruddii) based on atpAGD and rpoC: comparisons with 16S-23S rDNA-derived phylogeny. Current Microbiology, 2001, 42. vsk, nro 6, s. 419-421. DOI: 10.1007/s002840010240, PMID 11381334. Artikkelin verkkoversio. Viitattu 21.5.2012. (englanniksi)[vanhentunut linkki]
Aiheesta muuallaMuokkaa
- Candidatus Carsonella ruddiin kodonitaulukko (englanniksi)
- Scientific American – Tiny Genome May Reflect Organelle in the Making (englanniksi)
- http://www.biomedcentral.com/1471-2148/7/181