Borneo on hyvin vuoristoinen, erikoisestierityisesti sisäosiltaan. Korkein vuori on [[Kinabalu]] (4 175 metriä) Pohjois-Borneossa, joka on myös samalla Malesian korkein vuori. Ilmasto on lämmin ja kostea. Suurimman osan saaresta kattaa tiheä [[sademetsä]], jolla on rikas eläimistö [[sarvikuono]]ineen, [[norsu]]ineen, [[Oranki|orankeineen]], [[Gibboni|gibboneineen]], [[Krokotiili|krokotiileineen]], [[lisko]]ineen, [[Kilpikonna|kilpikonnineen]] ynnä muine lajeineen. Saarella on monia jokia, jotka ovat tärkeitä kulkuväyliä.
