Monen muun umpeenkasvavan järven tavoin Inhottujärvi on tärkeä [[lintujärvilintu]]järvi ja se kuuluu valtioneuvoston vuonna 1982 vahvistamaan valtakunnalliseen lintuvesien suojeluohjelmaan ja myös [[Natura 2000]] -ohjelmaan. Lintujärvenä järvi luetaan yhdeksi Etelä-Suomen parhaista. Järvellä esiintyviä lintulajeja ovat muiden muasssa [[kaakkuri]], [[mustakurkku-uikku]], [[kaulushaikara]], [[laulujoutsen]], [[uivelo]], [[ruskosuohaukka]], [[kurki]], [[luhtahuitti]], [[liro]], [[kalatiira]], [[mustatiira]] ja [[pikkulepinkäinen]]. Nisäkkäistä esiintyy muiden muassa [[saukko]]. Järvityypiltään järvi on rehevä osmankäämi-sarpiotyypin järvi. <ref>Saari 2006: 14-16.</ref><ref name="natura"/>
