Tarina lähtee käyntiin Vulcanilta;Vulkanukselta. tohtoriTohtori McCoyn ([[DeForest Kelley]]) ''[[HMS Bounty|Bountyksi]]'' nimeämää kaapattua klingonialusta varustetaan kotimatkaa varten. Spock alkaa tottua uuteen ruumiiseensa, joskaan ei esimerkiksi osaa vastata vointiaan koskevaan kysymykseen, vaan sanoo käsitteen olevan merkityksetön.
Retkikunta palaa kohti maataMaata, mutta ennen sitä on tuntemattomasta paikasta saapunut satelliittiMaan lähelle jättimäinen luotain, jota ei pystytä torjumaan ja joka on muuttamassa MaapallonMaan ilmastoa vähin erin ihmiselle tuhoisaksi. Spock saa sen viestit tulkittua: syynäluotain on setullut tutkimaan, ettämiksi maan merissä eläneetyhteys [[ryhävalas|ryhävalaatryhävalaisiin]] on tuhottukatkennut. sukupuuttoonMaan jamerissä seeläneet on aiheuttanut sen että satelliittiryhävalaat on tulluttuhottu paikallesukupuuttoon tutkimaanuseita signaaliensukupolvia katkeamisenaiemmin, syytämutta jaluotain nytyrittää seyhä kostaalöytää ihmisilleniihin älyllisenyhteyden rodunvoimakkailla tuhoamistaenergiasignaaleilla.
Kirk ja kumppanit lähtevät uhkayritykseen: on haettava menneisyydestä ryhävalaita menneisyydestä korvaamaan menetys, tai sivistysihmisten sivilisaatio kuolee. Uhkayritys päästä aikapoimuun kiihdyttämällä klingonialuksella silmukka auringon ympäri onnistuu, mutta dilitiumkiteet alkavat hajota;. tarvitaanTarvitaan tietynlaista säteilyä niiden kokoamiseen. ''Bounty'' laskeutuu San Franciscon puistoon joskus 1980-luvulla. Tarvittavaa säteilyä tuottava reaktori löytyy lentotukialus ''[[USS Enterprise (CVN-65)|USS Enterprise]]''lta. Tunkeutuminen onnistuu ja säteilytallennus saadaan - mutta [[Pavel Chekov|Chekov]] jää kiinni ja joutuu kuulusteltavaksi;. hänHän pakenee, mutta vammautuuputoaa putoamallaja vammautuu. Kirk, McCoy ja Uhura käyvät hakemassa hänet pois leikkauspöydältä ja hoitavat kuntoon - samaan aikaan kun sivuhuoneeseen lasioven taakse teljetyt kirurgit ja hoitajat katsovat ällistyneinä kuinka valtavaa leikkausta vaatinut aivovamma parannetaan ulkoisesti.
Valaat löytyvät vesipuistosta. Spock onnistuu tekemään vulkaanilaisen mielensulatuksen valaiden kanssa, ja saa nämä taivutettua yhteistyöhön - sillä ehdolla että ne tosiaan viedään turvaan. Samalla selviää, että naarasvalas on raskaana. Monen mutkan jälkeen valaat saadaan kyytiin ja samalla mukaan tulee yksin elänyt naistutkijavalastutkija Gillian ([[Jane Hicks]]),. jokaHän pääsee uuteen aikakauteen, jossa osoittautuu korvaamattomaksi: onhan hän sen aikakauden ainoa ryhävalaiden tuntija. Valaspari pääsee vapaaksi rajun pakkolaskun jälkeen ja ne välittävätvälittää tiedon satelliitilleluotaimelle, joka poistuu, ja Maan olot korjaantuvat.
''Enterprise''nEnterprisen tuhoamisesta nouseeseuraa oikeudenkäynti, ja klingonit vaativat Kirkin luovutusta heidän tuomittavakseen klingonien mielestä heitä kohtaan tehdyistä rikoksista. Vaatimukseen ei suostuta, jamutta Kirk saa tuomiokseen alennuksen amiraalista alemman asteen [[kommodori]]ksi, ja hänet siirretään takaisin uuden Enterprise-A:n kapteeniksi:. neuvostonNeuvoston puhemies ([[Robert Ellenstein]]) sanoo, että siinä tehtävässä hän on aina osoittanut ehdottoman pätevyytensä, ja siksi hänet siihen palautetaan.
