Yhdiste on tärkeä osa kasvien ja bakteerien tarvitsemien yhdisteiden synteesiä. Yhdisteen hiilirunko on osana muun muassa eräissä hormoneissa ja [[glykosidi|glykosideissä]]. Kasveissa ja bakteereisssa (E)-4-hydroksi-3-metyylibut-2-enyylipyrofosfaatti biosyntetisoidaan 2-C-metyyli-D-erytritoli 2,4-syklopyrofosfaatista [[4-hydroksi-3-metyylibut-2-enyylidifosfaattisyntaasi]]entsyymin katalysoimana. Terpeenien synteesissä (E)-4-hydroksi-3-metyylibut-2-enyylipyrofosfaatti muunnetaan [[4-hydroksi-3-metyylibut-2-enyylidifosfaattireduktaasi]]n vaikutuksesta [[isopentenyylipyrofosfaatti|isopentenyyli]]- ja [[dimetyyliallyylipyrofosfaatti|dimetyyliallyylipyrofosfaatiksi]].<ref>{{Lehtiviite | Tekijä =Wenyun Gao, Reik Loeser, Maja Raschke, Marco A. Dessoy, Michael Fulhorst, Henriette Alpermann, Ludger A. Wessjohann & Meinhart H. Zenk | Otsikko =(E)-4-Hydroxy-3-methylbut-2-enyl Diphosphate: An Intermediate in the Formation of Terpenoids in Plant Chromoplasts | Julkaisu =Angewandte Chemie International Edition | Ajankohta =2002 | Vuosikerta =41 | Numero =14 | Sivut =2604-2607 | Julkaisupaikka = | Julkaisija =Wiley International | Selite= | Tunniste= | www =http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/1521-3773%2820020715%2941:14%3C2604::AID-ANIE2604%3E3.0.CO;2-S/pdf | www-teksti =Artikkelin verkkoversio | Tiedostomuoto = | Viitattu = 24.8.2010 | Kieli ={{en}} | Lopetusmerkki = }}</ref><ref>{{Lehtiviite | Tekijä =W. Eisenreich, A. Bacher, D. Arigoni & F. Rohdich | Otsikko =Biosynthesis of isoprenoids via the non-mevalonate pathway | Julkaisu =Cellular and Molecular Life Sciences | Ajankohta =2004 | Vuosikerta =61 | Numero =12 | Sivut =1401-1426 | Julkaisupaikka = | Julkaisija =Springer | Selite= | Tunniste= | www =http://www.springerlink.com/content/aqtmfyyhlw0dcj2l/ | www-teksti =Artikkelin verkkoversio | Tiedostomuoto = | Viitattu = 24.8.2010 | Kieli ={{en}} | Lopetusmerkki = }}</ref>
Synteettisesti (E)-4-hydroksi-3-metyylibut-2-enyylipyrofosfaattia voidaan valmistaa kaksivaiheisella reaktiolla, jonka lähtöaine on 4-kloori-2-metyyli-2-butenaali. Reaktion [[saanto]] on 66%.<ref>{{Lehtiviite | Tekijä =David T. Fox & C. Dale Poulter | Otsikko =Synthesis of (E)-4-Hydroxydimethylallyl Diphosphate. An Intermediate in the Methyl Erythritol Phosphate Branch of the Isoprenoid Pathway | Julkaisu =The Journal of Organic Chemistry | Ajankohta =2002 | Vuosikerta =67 | Numero =14 | Sivut =5009–5010 | Julkaisupaikka = | Julkaisija =The American Chemical Society | Selite= | Tunniste= | www =http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/12098326 | www-teksti =Artikkelin abstrakti | Tiedostomuoto = | Viitattu = 24.8.2010 | Kieli ={{en}} | Lopetusmerkki = }}</ref>
