Opiskeluaikoinaan Künnapu kuului poikkitaiteelliseen Soup 69 -ryhmään<ref>[http://www.estonica.org/eng/lugu.html?menyy_id=874&kateg=41&alam=57&leht=6 Estonica.org]</ref>, jonka töissä yhdistyivät spirituaalisuus, [[pop-taide]] ja teknologinen [[futurismi]]. 70Künnapu on 1970-luvulta alkaen Künnapu kehittikehittänyt [[postmoderni]]a arkkitehtuuriteoriaa ja toteuttitoteuttanut mm. neuvostososialistisia kollektiivitiloja postmoderniin tyyliin. Hänen viimeaikaisia töitaan on kuvattu energiakeskipistearkkitehtuuriksi<ref>[http://vilenkunnapu.pri.ee/templid_sisu_eng/temples.html Vilenkunnapu.pri.ee]</ref>, joissa postmoderni estetiikka yhdistyy uskonnolliseen [[mystiikka]]an. Tuoreimpia töitä ovat [[Tartto|Tartossa]] [[Etanatorni]] ja sen viereen rakennettava [[Ahhaa-tiedekeskus]].<ref name="Kunnas">{{Lehtiviite | Tekijä =Kaja Kunnas| Otsikko =Etanatorni | Julkaisu =Helsingin Sanomat | Ajankohta =20.7.2010 | Sivut =C1}}</ref>