Franckin kapellimestariura on ollut vahvassa nousussa: hän on johtanut [[Pohjoismaat|Pohjoismaisten]] sinfoniaorkestereiden lisäksi muun muassa [[Berliinin filharmonikot|Berliinin filharmonikkoja]], [[Münchenin filharmonikot|Münchenin filharmonikkoja]], [[Chicagon sinfoniaorkesteri]]a, [[New Yorkin filharmonikot|New Yorkin filharmonikkoja]], [[Lontoon sinfoniorkesteri]]a ja [[Los Angelesin filharmonikot|Los Angelesin filharmonikkoja]]. Franck on toiminut [[Belgian kansallinen orkesteri|Belgian kansallisen orkesterin]] taiteellisena johtajana vuodesta [[2002]].
[[Elokuu]]ssa [[2006]] Franck aloitti [[Suomen Kansallisooppera]]n ylikapellimestarina, mutta irtisanoutui yllättäen 14.2. helmikuuta 2007. Irtisanoutumisen syyksi Franck ilmoitti näkemyserot talon johdon kanssa. Vuoden irtisanomisajasta johtuen Mikko Franckin töiden Kansallisoopperassa piti päättyä 14.2. helmikuuta 2008. Franckin irtisanoutumisen jälkeen Kansallisoopperan hallintoneuvosto, hallitus, pääjohtaja ja säännöt vaihtuivat. Pääjohtaja [[Erkki Korhonen|Erkki Korhosen]] eron jälkeen Franck toimi oopperan taiteellisen toimikunnan puheenjohtajana. Kansallisoopperan hallitus päätti marraskuussa 2007 valita Franckin oopperan taiteelliseksi johtajaksi ja uudelleen ylikapellimestariksi.<ref>Helsingin Sanomat 22.11.2007</ref> Lopullisen nimityksen oopperan säätiön hallitus tekeeteki 18joulukuussa 2007. joulukuutaFranck 2007aloittaa uudessa tehtävässään vuoden 2008 alussa ja hänen sopimuksensa on voimassa vuoden 2011 heinäkuun loppuun asti. Sopimus sisältää option kahden vuoden jatkoajasta. Franck vastaa oopperan ohjelmiston ja konserttien taiteellisesta suunnittelusta pääjohtaja [[Päivi Kärkkäinen|Päivi Kärkkäisen]] alaisuudessa.<ref>Helsingin Sanomat 22http://www.11yle.2007fi/uutiset/kulttuuri/oikea/id77877.html</ref>
