Ero sivun ”Mendelistinen satunnaistaminen” versioiden välillä

MS-kokeissa huomioidaan koehenkilöiden tiettyjen [[geeni]]nen eri muotojen eli [[alleeli]]en tunnettu vaikutus riskitekijän (esimerkiksi [[etanoli]]n juonnin) kautta lopputulemaan (esimerkiksi [[verenpainetauti]]in). Täten lopputulemasta voidaan poistaa laskennallisesti näiden alleelien vaikutukset ja riskitekijän vaikutusta lopputulemaan voidaan tarkastella ilman perinnöllisten tekijöiden vaikutusta. Geenien sijaan MS-kokeissa voidaan käyttää muitakin tekijöitä. Niiden tulee kuitenkin noudattaa ominaisuuksiltaan tiettyjä sääntöjä, joita lähinnä vain geenit noudattavat, sillä yksilön geenit ovat muun muassa ulkoisista tekijöistä riippumattomia. Nämä säännöt on esitelty tarkemmin kohdassa [[Mendelistinen satunnaistaminen#Alleelien säännöt|alleelien säännöt]].<ref name=a/>

MS-kokeessa alleeleita saatetaan kutsua englanniksi nimellä ''instrumental variables''. Usein MS-kokeissa tarkastellaan monia riskitekijään vaikuttavia geenejä, sillä yhden geenin alleelit eivät välttämättä vaikuta suuresti riskitekijän kautta lopputulemaan. Englanniksi yhteenYhteen riskitekijään vaikuttavien huomioitujen geenien lukumäärästä käytetään englanniksi nimeä ''allele score''.<ref name=a/>

Jos alleeli vaikuttaa jonkun muun riskitekijän kautta lopputulemaan, kuin vain tarkastellun riskitekijän kautta, kutsutaan tätä ilmiötä englanniksi nimellä ''horizontal pleiotrophy'' (katso [[Mendelistinen satunnaistaminen#Alleelien säännöt|alleelien säännöt]] ja 3. kohta). Nimeä ''vertical pleitotrophypleiotrophy'' käytetään tarkastellun alleelin, sen riskitekijän ja sen lopputuleman välisistä vaikutuksista. Vaihtoehtoisesti ''vertical pleiotrophy'' tarkoittaa muita vaikutuksia, kuten tarkastellun lopputuleman vaikutuksistavaikutuksia muihin lopputulemiin, tai tarkasteltuun alleeliin liittymättömistäliittymättömiä vaikutuksista, jotka kuitenkin kohdistuvat tarkasteltuun riskitekijään.<ref name=a/>

Kunkin MS-kokeeseen valitun geenin [[alleeli|alleeleihi]]n tulee päteä kolme kohtaa.

#kohta: alleelin tulee liittyä tunnetulla tavalla tarkasteltuun lopputulemaan (esimerkiksi sairauden kehittymiseen).<ref name=a/>

#kohta: alleeli ei saa vaikuttaa lopputulemaan muiden (sairaudelle altistavien) riskitekijöiden kautta kuin tarkastellun riskitekijän kautta.<ref name=a/>

Yksinkertaistetussa MS-kokeen esimerkissä, jossa ''alleeli'' on [[etanoli]]a kehossa hajottava [[alkoholidehydrogenaasi]], ''riskitekijä'' on etanolin juonti ja ''lopputulema'' on [[verenpaine]], voidaan selvittää, että miten juodun etanolin määrä pitkällä aikavälillä vaikuttaa verenpaineeseen riippumatta koehenkilöiden perinnöllisestä alkoholidehydrogenaasin tehosta. Kokeessa edellä mainittu 1. kohta pätee, sillä alkoholidehydrogenaasin tiedetään vaikuttavan etanolin hajotukseen, kunhan myös sen eri geenimuunnelmien vaikutus etanolin kulutukseen ja verenpaineeseen tunnetaan niin hyvin, että niiden aiheuttamalle verenpaineriskille voidaan antaa jokin numeroarvo. Siten niiden vaikutus verenpaineeseen voidaan laskennollisesti poistaa tutkimuksen lopputuloksesta. 2. kohta ei päde esimerkiksi jos alkoholidehydrogenaasin tietty muoto on yleinen tietyllä [[Etninen ryhmä|etnisellä ihmisryhmällä]], joilla on etanolin kulutukseen liittymättömien [[kulttuuri]]llisten syiden (esimerkiksi ruokavalion) takia alhainen verenpaine. Tällöin alleelia ei siis voida käyttää MS-kokeessa. 3. kohta ei päde esimerkiksi jos alkoholidehydrogenaasin alleelit vaikuttavat samanaikaisesti myös [[tupakanpoltto]]on, jonka taas tiedetään vaikuttavan verenpaineeseen.<ref name=a>{{Lehtiviite|Tekijä=NM Davies, MV Holmes, GD Smith|Otsikko=Reading Mendelian randomisation studies: a guide, glossary, and checklist for clinicians|Julkaisu=BMJ|Ajankohta=2018|Vuosikerta=362|Pmid=30002074|Doi=10.1136/bmj.k601|Issn=0959-8138|www=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6041728/}}</ref>