Finnfund hoitaa joitakin rahoitushankkeita muun muassa [[veroparatiisi]] [[Mauritius|Mauritiuksen]] kautta, mitä yhtiö perustelee sillä, että kohdemaan verotuslainsäädäntö ja viranomaistoiminta on kehittymätöntä tai hyvin epäselvää, eikä se halua tuhlata suomalaisten veronmaksajien rahoja.<ref name="SS01032016"/>
Hondurasissa murhattiin maaliskuussa 2016 alkuperäiskansa- ja ympäristöaktivisti [[Berta Cáceres]], joka vastusti [[Agua Zarcan vesivoimalahanke|Finnfundin Hondurasissa rahoittamaa vesivoimalahanketta]]. Finnfund ja hollantilainen FMO keskeyttivät hankkeen rahoituksen välittömästi tämän jälkeen. Finnfund rahoitti hanketta yhteensä kahdella miljoonalla eurolla. Finnfundin mukaan paikallisia yhteisöjä oli kuunneltu ennen rahoituspäätöksen tekemistä ja yrityksen käsityksen mukaan suurin osa paikallisista tuki hanketta. Lopullisesti Finnfund vetäytyi hankkeesta kesällä 2017.<ref name="HS02112017"/>
Murhan taustoista laaditunlaadittiin syksyllä 2017 raportti, raportinjonka mukaan Finnfundin yhteistyöyritys [[Desarrollos Energéticos]] (Desa) ja [[Honduras|Hondurasin valtion]] edustajat suunnittelivat ja toteuttivat murhan ja peittelivät sitä. Raportin mukaan Finnfund ja muut voimalan rahoittajat suhtautuivatolivat suhtautuneet piittaamattomasti Desan toimiin, eivätkä olleet tehneet tarpeeksi suojellakseen voimalahankkeen alueella asuvien alkuperäiskansojen ihmisoikeuksia tai Cáceresin henkeä., Raportin mukaan rahoittajat eiväteivätkä tehneet tarpeeksi varmistaakseen, että murhasta tehdään asianmukainen rikostutkinta. Finnfundin toimitusjohtaja [[Jaakko Kangasniemi]] kiisti Finnfundin olleen tietoinen tai osallinen murhaan. Murhan tutkinta onoli vielä kesken ja pidätettynämarraskuussa on2017 pidätettyinä oli muun muassa Finnfundin yhteistyökumppaninDesan ympäristövastaava sekä entinen turvallisuusjohtaja. Finnfund vetäytyi hankkeesta puolitoista vuotta murhan jälkeen, mutta maksoi sitä ennen voimalahankkeelle kaksi miljoonaa euroa.<ref name="HS02112017">{{Verkkoviite|osoite=https://www.hs.fi/ulkomaat/art-2000005434445.html|nimeke=Finnfundin entinen kumppaniyhtiö Hondurasissa suunnitteli ja toteutti aktivistin murhan, uusi raportti väittää – syyttää myös Finnfundia piittaamattomuudesta|tekijä=|julkaisu=Helsingin Sanomat|ajankohta=2017-11-02|julkaisija=Sanoma Media Finland|viitattu=2017-12-05|ietf-kielikoodi=fi-FI}}</ref>
