BUD/S-koulutus kestää 24 viikkoa ja karsii suurimman osan osallistujista. Se alkaa kolmen viikon orientaatiokurssilla (BUD/S Orientation Course), jossa tutustutaantotutellaan BUD/S-koulutuksen fyysisiin harjoituksiin maalla ja meressä. Varsinainen BUD/S-koulutus alkaa seitsemän viikon jaksolla (First Phase), jonka painopiste on SEAL-kandidaattien fyysisen ja psyykkisen kestävyyden testaamisessa. SEAL-kandidaatit joutuvat jatkuvasti tekemään ankaria fyysisiä harjoituksia ja palelemaan kylmässä merivedessä, mikä saa monet keskeyttämään kurssin (DOR eli drop on request). NeljäsEnsimmäisen jakson neljäs viikko on ns. "Hell Week", jonka aikana kurssilaisia hyökytetään lähes tauotta ja he saavat nukkua vain muutaman tunnin viiden vuorokauden aikana. Toisella seitsemän viikon jaksolla (Second Phase) keskitytään sukeltajakoulutukseen. Kolmas seitsemän viikon jakso (Third Phase) painottuu maasodankäyntiin, jajossa koulutusaiheina ovat mm. taktiikka, aseet, rähjähdysaineet, partiointi ja tiedustelu.<ref>{{Kirjaviite|Tekijä=Dick Coach|Nimeke=The Warrior Elite. The Forging of SEAL Class 228|Vuosi=2013|Sivu=345-347|Julkaisija=Three Rivers Press}}</ref>
BUD/S-kurssin läpäisseet suorittavat viiden viikon laskuvarjohyppykurssin ennen siirtymistään SQT-kurssille.
===SEAL Qualification Training (SQT) ===
Koulutus jatkuu 26 viikkoa kestävällä SQT-kurssilla, jossa syvennytään mm. suunnistukseen, pienryhmätaktiikkaan, lähitaisteluun, tarkka-ammuntaan, viestikoulutukseen, lääkintäkoulutukseen, vesistökoulutukseen ja taktisiin laskuvarjohyppyihin. Tässä vaiheessa SEAL-kandidaatien on suoritettava myös selviytymiskoulutus (SERE eli Survival, Evasion, Resistance, Escape). SQT-kurssin läpäisseet saavat rintaansa SEAL-tunnuksen (Trident eli Naval Special Warfare Insignia). Sen jälkeen he suorittavat Alaskassa kolme viikkoa kestävän kylmien olosuhteiden vesistökoulutuskurssin ennen siirtymistään operatiiviseen SEAL-joukkueeseen, jossa heillä on edessään vielä 18 kuukauden koulutus ennen ensimmäistä ulkomaankomennusta. Tähän koulutukseen kuuluu mm. 12-36 viikonviikkoa kestävä vieraan kielen kurssi sekä erilaisia erikoistumiskursseja. Esimerkiksi Lääkintämiehiksi valitut SEALit käyvät laivaston kahdeksan viikon lääkintämieskurssin (Navy Independent Duty Corpsman Course) sekä 24 viikon erikoisoperaatioiden taistelulääkintäkurssin (Special Operations Combat Medic Course). SEALien on mahdollista suorittaa myös maavoimien kursseja, kuten Ranger- tai Pathfinder-kurssi.<ref>{{Kirjaviite|Tekijä=Mir Bahmanyar|Nimeke=US Navy SEALs|Vuosi=2005|Sivu=6-7|Julkaisija=Osprey Publishing}}</ref>
