Ero sivun ”Aminohapot” versioiden välillä

[katsottu versio][katsottu versio]
Poistettu sisältö Lisätty sisältö
Aiheesta muualla
kh
Rivi 88:
Aminohapot voidaan jakaa ryhmiin useammilla tavoilla sivuketjujen ominaisuuksiensa mukaan. Yksi ryhmittelytapa sivuketjujen mukaan'''<ref>{{Kirjaviite|Tekijä=Moran L., Horton R., Scrimgeour G., Perry M.|Nimeke=Principles of Biochemistry|Vuosi=2014|Sivu=85|Julkaisija=Pearson Education ltd}}</ref>''' , '''kukin yksittäinen ryhmä ''kasvavan koon mukaan,''''' (esimerkiksi GAVLI; koot G<A<V<L = I, leusiini ja isoleusiini ovat isomeerejä) on
# Alifaattiset (suoraketjuiset) (G)AVLI. '''Hiilien määrä''' sivuketjuissa (0), 1, 3, 4, 4 → '''(G)AVLI 1344''', glysiini on suluissa koska sillä ei siis ole hiiliketjua
# Aromaattiset '''FYW'''; fenyylialaniini F = alaniini + fenyyliryhmä; Y = tyrosiini = F + -OH (eli fenoli), W eli tryptofaani on (sivuketjultaan) metyyliryhmään kiinnittynyt heterosyklinen 5-rengas kiinni fenyyliryhmässä eli summaltaan F + 5-rengas. Kaikki kolme ovat aromaattisia. (Myös histidiinin sivuketju on aromaattinen (koska sivuketjun heterosyklinen eli tässä tapauksessa typpeä sisältävä 5-rengas on tasomainen, sen kaikki atomit ovat sp2-hybridisoituneita ja sillä on pariton määrä (3) elektronipareja renkaan atomien p-orbitaaleilla eli käytettävissä delokalisoituneihin π-sidoksiin; täten se täyttää aromaattisuuden kolme vaatimusta, vaikkei sisälläkään fenyyliryhmää) <ref>{{Kirjaviite|Tekijä=Bruice, Paula Yurkanis|Nimeke=Organic Chemistry 7th edition|Vuosi=2014|Sivu=343-351343–351|Julkaisija=Pearson Education}}</ref>,
# Rikkiä sisältävät CM; kysteiinissä hiilen ja rikin summa on 2, metioniinissä taas se on 4 → '''CM24''' (CityMarket24). Kysteiini tekee rikkisiltoja proteiineissa (C.llä on terminaalinen -SH eli tioliryhmä), metioniini taas ei muodosta rikkisiltoja, mistä voi muistaa myös sen että kysteiinissä rikki on päässä eli terminaalinen, metioniinissa taas rikki ''ei'' ole terminaalinen vaan toiseksi viimeisenä osana neliosaista ketjua.
# Alkoholit ST; kummassakin hydroksyyliryhmä on kiinni ensimmäisessä alfahiileen kiinnittyneessä (sivuketjun) hiilessä. Seriinin (S) sivuketjussa on yksi hiili, treoniinin (T) sivuketjussa kaksi hiiltä → '''ST1''' (huoltoasema) '''tai ST112''' (numero 1 tulee siitä, että hydroksyyliryhmä on kiinni 1. hiilessä kummassakin sivuketjussa, 1 ja 2 ovat hiilten lukumäärät)