Nuori suistokrokotiili on väriltään haaleankeltainen. Sillä on ruumiissa ja hännässä mustia raitoja ja täpliä. Väritys säilyy tällaisena, kunnes krokotiili kasvaa aikuiseksi. Aikuisena suistokrokotiilin ruumiin väri on paljon tummempi, ja siellä täällä voi olla vaaleanruskeita tai harmaita alueita. Vatsa on väriltään valkoinen tai keltainen. Ruumiin alaosassa on raitoja, mutta ne eivät ulotu vatsaan asti. Häntä on harmaa, ja siinä on tummia läiskiä<ref name="adw" />.
Terve suistokrokotiiliuros saavuttaa tyypillisesti 4,8–5 metrin pituuden, mutta voi kasvaa 6–7-metriseksikin<ref name="adw" />. SuurinSuurinta varmistettuvarmistettua pituusennätyskokoennätystä onpitää hallussaan ”Lolongiksi” nimetty eläin, jolla oli pituutta 6,17 metriä ja painoa "Lolongiksi"1 075 nimetylläkiloa<ref>{{Verkkoviite eläimellä| onOsoite 1075= kghttps://news.nationalgeographic.com/news/2012/07/120702-biggest-crocodile-lolong-guinness-world-records-animals-science/| (nationalNimeke geographin= mukaan)Giant Crocodile Breaks Size Record—Suspected in Fatal Attacks| Tekijä = Dell’Amore, Christine| Julkaisu = National Geographic News| Ajankohta = 3.7.2012| Viitattu = 16.12.2018| Kieli = {{en}}}}</ref>. Myös suurempia pituuksia on ilmoitettu, mutta niiden uskotaan olevan liioiteltuja<ref name="whichis">{{Verkkoviite|Tekijä=Adam Britton|Nimeke=Which is the largest species of crocodile?|Osoite=http://www.flmnh.ufl.edu/natsci/herpetology/brittoncrocs/cbd-faq-q2.htm|Ajankohta=|Julkaisija=|Luettu=23.3.2007|Kieli={{en}} }}</ref>. Myös suurempia pituuksia on ilmoitettu, mutta niiden uskotaan olevan liioiteltuja<ref name="whichis" />, sillä yli viisimetriset suistokrokotiilit ovat harvinaisia<ref name="appearance" />. Naaraspuoliset suistokrokotiilit eivät kasva yhtä suuriksi kuin [[Uros|urokset]]. Jo 2,5 metriä pitkää yksilöä voi pitää suurena, eivätkä [[Naaras|naaraat]] tavallisesti kasva kolmea metriä pidemmiksi<ref name="appearance" />. Viisi metriä pitkä aikuinen suistokrokotiili painaa yleensä 400–500 kiloa<ref name="appearance" />, mutta uros voi painaa 770 kiloa.
Suistokrokotiililla on suurikokoinen pää. Leuat ovat järeät, ja [[Hammas|hampaita]] on 64–68 kappaletta<ref name="adw" />. Suistokrokotiileilla on erittäin vahvat leuat ja niiden purentavoimaksi on mitattu jopa 1,1 tonnia.
