Ero sivun ”Digimon” versioiden välillä

Sarja sijoittuu kolme vuotta ''Digimon Zero Twon'' jälkeen, kun ihmisten maailmaan ilmestyy salaperäiselle tartunnalle ilmestyneitä digimoneja aiheuttamaan tuhoa. Taichi Yagami ja muut ''Digimon Adventuresta'' tutut Valitut lapset tapaavat jälleen vanhat digimonkumppaninsa ja saavat tukea Japanin hallitukselta, Daisuken, Miyakon, Iorin ja Kenin hävittyä taistelun Alphamonia vastaan ja kadottua jälkiä jättämättä. Taichi ja muut tapaavat myös uuden Valitun lapsen nimeltä Meiko Mochizuki ja tämän kumppanin [[Meicoomon]]in, joista tulee hedinäheidän ystäviään. Mutta yhtäkkiä Meicoomon muuttuu vihamieliseksi ja pakenee. Kun Meicoomon paljastuu tartunnan aiheuttajaksi, Valitut lapset kuulevat kuinka Digimaailma uudelleenkäynnistetään sen ja ihmisten maailman suojelemiseksi, mutta tämän seurauksena digimonkumppanit menettävät muistinsa. Uudelleenkäynnistyksen jälkeen, Valitut lapset palaavat Digimaailmaan ja tapaavat jälleen kumppaninsa aloittaakseen heidän kanssaan alusta. Mutta heidän kimppuunsa hyökkää Digimon-keisarin ja Gennain ulkomuotoja käyttänyt salaperäinen mies, joka kertoo isäntänsä Yggdrasilin pyrkivän eristämään ihmiset ja digimonit toisistaan ikiajoiksi. Digimaailman "uudelleenkäynnistystä" oli käytetty tuomaan takaisin kaikki uudelleensyntymättömät digimonit ja Meicoomonin voimaa oli käytetty tekemään niistä armeija ihmisten tuhoamiseksi ja todellisen maailman valloittamiseksi. Estääkseen Yggdrasilin aikeet, Homeostasis ja tämän palvelija Hackmon päättävät tuhota Meicoomonin, jonka paljastetaan syntyneen Apocalymonin datan jäänteistä. Valittujen lasten on valittava Meicoomonin tuhoamisen tai sekä Yggdrasilin että Homeostasiksen vastustamisen välillä. Mutta ennen kuin he voivat päättää, Meicoomonin Mega-muoto Raguelmon yhdistyy Tailmonin korruptoituneen Mega-muodon, Ophanimon Falldown Moden, kanssa tuntemattomaksi digimoniksi[[Ordinemon]]iksi, joka aikoo yhdistää todellisen maailman osaksi Digimaailmaa. Elokuvissa useat Valitut lapset saavat kumppaninsa digivoitumaan ensimmäistä kertaa Mega-muotoihinsa, mihin aiemmin vain Taichi ja Yamato ovat pystyneet.