Varhaiset kiinalaiset istorialliset lähteet mainitsevat Kuqan pienenä Guici-nimisenä kuningaskuntana. Paikalliset asukkaat puhuivat alunperinalun perin [[Tokaarilaiset kielet|tokaarisiin kieliin]] kuuluvaa tokaari B:tä. Tokaarilaiset kielet kuuluvat [[Indoeurooppalaiset kielet|indoeurooppalaiseen kielikuntaan]]. Paikka sijaitsi historiallisen [[silkkitie]]n pohjoishaaran varrella ja Kuqasta kehkeytyi tärkeä [[buddhalaisuus|buddhalaisuuden]] keskus.<ref name="brit">{{Verkkoviite | Osoite = https://www.britannica.com/place/Kucha | Nimeke = Kucha | Tekijä = | Tiedostomuoto = | Selite = | Julkaisu = Encyclopædia Britannica | Ajankohta = | Julkaisupaikka = | Julkaisija = | Viitattu = 17.11.2017 | Kieli = {{en}} }}</ref> Buddhalaisuus levisi muuallekkinmuuallekin [[Tariminn allas|Tarimin altaan]] alueelle silkkitietä pitkin, mutta Kuqa oli alueen buddhalaisista keskuksista yksi ensimmäisistä ja se omaksuttiin Kuqassa ensimmäisellä vuosisadalla [[jaa.]] Yksi tunnetuimmista buddhalaisia tekstejä [[kiinan kieli|kiinaksi]] kääntäneistä oli [[Kumarajiva]] (344-413) ja hän oli syntynyt Kuqassa. Kiinalainen pyhiinvaeltaja [[Xuanzang ]] kuvaili 630-luvulla Kuqassa olevan ata luostaria ja noin 5 000 munkkia. Yksi tärkeimmistä luostareista oli [[Kizilin luolat]] nykyisen Kuqan länsipuolella.<ref>{{Verkkoviite | Osoite = https://depts.washington.edu/silkroad/exhibit/religion/buddhism/tarim/kizil.html | Nimeke = Kucha and the Kizil Caves | Tekijä = Daniel C. Waugh | Tiedostomuoto = | Selite = | Julkaisu = Silk Road Seattle | Ajankohta = | Julkaisupaikka = | Julkaisija = University of Washington. | Viitattu = 17.11.2017 | Kieli = {{en}} }}</ref> Buddhalaisuuden ohella kaupunki oli tunnettu myös muusikoistaan.<ref name="brit" />
Kiinan [[Tang-dyanastia]] hallitsi Kuqan kuningaskuntaa vuodesta 658 700-luvun loppupuolelle saakka. Sen jälkeen kiinan valta alueella muuttui lähinnä muodolliseksi ja [[uiguurivaltakunta|uiguurivaltakunnan]] hajottua [[Turfan]]iin asettuneet [[uiguurit]] valtasivat Kuqan alueen. Sittemmin sen asukkaat kääntyivät [[islam]]in uskoon ja kiinalaisvalta palasi alueelle 1700-luvulla. Nykyaikana kaupunkiin on tullut [[han-kiinalaiset|han-kiinalaisia]] siirtolaisia ja kaupunki on jakautunut muslimien ja kiinalaisten asuttamiin kaupungin osiin.<ref name="brit" />