Ero sivun ”Viimeinen universaali esivanhempi” versioiden välillä

[katsottu versio][katsottu versio]
Poistettu sisältö Lisätty sisältö
muutin Ominaisuudet -osiossa olleen luettelon proosaksi; artikkelissa on nyt keskeisimmät asiat, joten poistin Kesken -mallineen
→‎Ominaisuudet: korvasin arkistoidun linkin
Rivi 9:
organismi. Sillä oli todennäköisesti nykyisten bakteereiden tavoin renkaan muotoinen kela [[DNA]]:ta, joka kellui vapaasti [[solu]]n sisällä. Morfologisesti se ei olisi ollut kovinkaan erilainen nykypäivän yleistetystä pienikokoisesta bakteerista. Carl Woese, joka oli ensimmäinen ehdottamaan nykyisin käytettyä kolmen yläkunnan [[Tieteellinen luokittelu|luokittelujärjestelmää]] bakteerien, arkeonien ja aitotumaisten <!--16S -->rRNA-jaksojen analysoinnin perusteella, on kuitenkin sanonut, että LUAn geneettisen koneiston näkökulmasta se olisi ollut "...yksinkertaisempi, alkeellisempi yksilö kuin ne jälkeläiset, jotka poikivat kolme [yläkuntaa] (ja näiden jälkeläiset)".<ref>{{Lehtiviite |Tekijä = Woese, C. R.; Kandler, O.; Wheelis, M. L. | Otsikko =Towards a natural system of organisms: proposal for the domains Archaea, Bacteria, and Eucarya | Julkaisu =Proceedings of the National Academy of Sciences | Ajankohta =1.6.1990 | Julkaisupaikka = | Julkaisija = | Selite= | Tunniste= | www =http://www.pnas.org/content/87/12/4576 | www-teksti = | Tiedostomuoto = | Viitattu = 13.9.2016 | Kieli ={{en}} |Issn = 0027-8424 |Pmid = 2112744 |Sivut = 4576–4579 |Vuosikerta = 87 |Numero = 12 |Doi = 10.1073/pnas.87.12.4576 |Pmc=54159 }} Lainaus: "...simpler, more rudimentary entity than the individual ancestors that spawned the three [domains] (and their descendants)"</ref>
 
Vaikka LUA:n anatomian rekonstruointiin liittyy suurta epävarmuutta, voimme kuitenkin kuvailla sen sisäisiä mekanismeja yksityiskohtaisesti kaikille maapallolla nykyisin itsenäisesti eläville organismeille yhteisten ominaisuuksien perusteella.<ref name="Wächtershäuser-1998">{{Lehtiviite |Tekijä=Wächtershäuser, Günter |Vuosi=1998 |Otsikko=Towards a Reconstruction of Ancestral Genomes by Gene Cluster Alignment |Julkaisu=Systematic and Applied Microbiology |Vuosikerta=21 |Numero=4 |Sivut=473–4, IN1, 475–7 |Doi=10.1016/S0723-2020(98)80058-1 |Kieli={{en}} }}</ref><ref name="Gregory-Clinton">{{verkkoviite |osoite=https://web.archive.org/web/2016030320054120120413170420/http://faculty.clintoncc.suny.edu/faculty/Michaelmichael.Gregorygregory/files/Biobio%20101/Bio%20101%20Lectures/Life/life.htm |nimeke=What is Life? |Tekijä=Gregory, Michael |Julkaisija=Clinton College |kieli={{en}} }}</ref><ref name="Pace-2001">{{lehtiviite |Tekijä=Pace NR |Otsikko=The universal nature of biochemistry |Julkaisu=Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America |Vuosikerta=98 |Numero=3 |Sivut=805–8 |Ajankohta=tammikuu 2001 |Pmid=11158550 |Pmc=33372 |Bibcode=2001PNAS...98..805P |Doi=10.1073/pnas.98.3.805 |Kieli={{en}} }}</ref><ref name="Wächtershäuser-2003">{{lehtiviite |Tekijä=Wächtershäuser G |Otsikko=From pre-cells to Eukarya--a tale of two lipids |Julkaisu=Molecular Microbiology |Vuosikerta=47 |Numero=1 |Sivut=13–22 |Ajankohta=tammikuu 2003 |Pmid=12492850 |Doi=10.1046/j.1365-2958.2003.03267.x |Kieli={{en}} }}</ref>
 
[[Geneettinen koodi]] perustui todennäköisesti [[DNA]]:han.<ref name="PiP">{{lehtiviite|Otsikko= Patterns In Palaeontology: The first 3 billion years of evolution|Tekijä=Garwood, Russell J.|Vuosi=2012|Julkaisu=Palaeontology Online|Vuosikerta=2|Numero=11|Sivut=1–14|www=http://www.palaeontologyonline.com/articles/2012/patterns-in-palaeontology-the-first-3-billion-years-of-evolution/ |Kieli={{en}} |Viitattu= }}</ref> On kuitenkin huomioitava, että jotkut tutkimukset ovat ehdottaneet, että LUA:lta puuttui DNA täysin ja että se perustui kokonaan [[RNA]]:han.<ref>{{verkkoviite |tekijä=Marshall, Michael |nimeke=Life began with a planetary mega-organism |osoite=https://www.newscientist.com/article/mg21228404-300-life-began-with-a-planetary-mega-organism/ |julkaisu= New Scientist |julkaisija=Reed Business Information |ajankohta=23.11.2011 |kieli={{en}} }}</ref> Jos DNA:ta oli läsnä, sen koostumus oli seuraavanlainen. DNA koostui neljästä [[nukleotidi]]sta ([[deoksiadeniini]], [[deoksiguaniini]], [[deoksisytosiini]] ja [[deoksitymiini]]), poissulkien muut mahdolliset deoksinukleotidit. DNA pidettiin kaksijuosteisena [[DNA-polymeraasi]] -nimisen [[entsyymi]]n avulla. DNA:n eheydestä pitivät huolen joukko entsyymeitä, joihin lukeutui [[DNA-topoisomeraasi]], [[DNA-ligaasi]] ja muita [[DNA:n korjaus]] entsyymeitä. DNA:ta suojelivat myös siihen kiinnittyneet proteiinit, kuten [[histoni]]t. Geneettinen koodi koostui kolmen nukleotidin [[kodoni|kodoneista]], tuottaen 64 eri kodonia. Koska vain 20 [[aminohapot|aminohappoa]] käytettiin, useat kodonit koodaavat samoja aminohappoja.<ref name="Wächtershäuser-1998"/><ref name="Gregory-Clinton"/><ref name="Pace-2001"/><ref name="Wächtershäuser-2003"/> Jos koodi perustui DNA:han, silloin sen toiminta oli seuraavanlainen. Geneettisen koodin ilmeneminen tapahtui yksijuosteisten RNA-välituotteiden kautta. RNA:n tuotto tapahtui DNA:sta riippuvaisen [[RNA-polymeraasi]]n avulla. RNA:ssa käytettiin nukleotideja, jotka olivat samanlaisia kuin DNA:ssa olevat nukleotidit. Ainoa poikkeus oli, että DNA:ssa olevan [[tymiini]]n sijaan RNA:ssa käytettiin [[uridiini]]a.<ref name="Wächtershäuser-1998"/><ref name="Gregory-Clinton"/><ref name="Pace-2001"/><ref name="Wächtershäuser-2003"/>