Ero sivun ”Viimeinen universaali esivanhempi” versioiden välillä

[katsottu versio][katsottu versio]
Poistettu sisältö Lisätty sisältö
aloitin Hypoteesit -osion en-wikistä käännetyllä tekstillä
Rivi 37:
[[Tiedosto:Phylogenetic tree.svg|right|thumb|350px|[[Kladistiikka|Kladogrammi]], joka linkittää kaikki suuret eliöryhmät LUA:an (pohjalla oleva musta runko). Tämä kaavio perustuu dataan, joka on kerätty [[Ribosomaalinen RNA|ribosomaalisen RNA]]:n sekvensoinnista.]]
 
Vuonna 1859 [[Charles Darwin]] julkaisi ''Lajien synnyn'', jossa hän kahdesti esitti hypoteesin[[hypoteesi]]n, että olisi ollut vain yksi progenootti kaikille elämänmuodoille. Hän teki analogiaan perustuvan johtopäätöksen ja kirjoitti tämän perusteella, että "kaikki elolliset oliot, mitkä milloinkaan ovat tämän maan pinnalla eläneet, ovat voineet polveutua jostakin yhteisestä kantamuodosta".<ref name="Darwin-1913"/> Hän viittasi hypoteesiin uudelleen viimeisessä lauseessa: “Jotakin suuremmoista on tässä ajatuksessa, että Luoja on puhaltanut elämän ja sen voimat aluksi vain muutamiin harvoihin tai yhteen ainoaan muotoon ja että kiertotähtemme kiertäessä rataansa järkähtämättömän painolain mukaisesti tuosta yksinkertaisesta alusta on kehittynyt ja edelleen kehittyy mitä kauneimpia ja ihmeellisimpiä muotoja.”<ref name="Darwin-1913"/>
Silloin kun LUA:n olemassaolosta esitettiin hypoteeseja, elävien solujen [[geneettinen etäisyys|geneettiseen etäisyyteen]] perustuvat [[kladistiikka|kladogrammit]] viittasivat siihen, että [[arkeoni]]t erkaantuivat aikaisin muusta elämästä. Tähän johtopäätökseen tultiin sen perusteella, että kaikki tunnetut arkeonit voivat selviytyä erittäin vaikeissa olosuhteissa, kuten korkeassa suolapitoisuudessa, lämpötilassa ja happamuudessa. Tämän takia jotkut tieteilijät ehdottivat, että LUA kehittyi syvänmeren aukkojen kaltaisissa ympäristöissä, joissa tämän kaltaiset ääriolosuhteet vallitsevat nykyisin. Arkeonit löydettiin kuitenkin vähemmän vaativista ympäristöistä. Nykyisin uskotaan, että ne ovat lähempää sukua [[aitotumaiset|aitotumaisiin]] kuin [[bakteerit|bakteereihin]], vaikka monet yksityiskohdat ovat vielä tuntemattomia.<ref>{{lehtiviite |Tekijä=Xie Q, Wang Y, Lin J, Qin Y, Wang Y, Bu W |Otsikko=Potential key bases of ribosomal RNA to kingdom-specific spectra of antibiotic susceptibility and the possible archaeal origin of eukaryotes |Julkaisu=PLoS ONE |Vuosikerta=7 |Numero=1 |Sivut=e29468 |Vuosi=2012 |Pmid=22247777 |Pmc=3256160 |Doi=10.1371/journal.pone.0029468 |Kieli={{en}} }}</ref><ref>{{lehtiviite |Tekijä=Yutin N, Makarova KS, Mekhedov SL, Wolf YI, Koonin EV |Otsikko=The deep archaeal roots of eukaryotes |Julkaisu=Molecular Biology and Evolution |Vuosikerta=25 |Numero=8 |Sivut=1619–30 |Ajankohta=elokuu 2008 |Pmid=18463089 |Pmc=2464739 |Doi=10.1093/molbev/msn108 |Kieli={{en}} }}</ref>
Rivi 43:
[[Tiedosto:Horizontal-gene-transfer.jpg|left|thumb|250px|2005 julkaistu [[evoluutiopuu]], josta näkyy geenien siirtymisen eri haarojen välillä, muodostaen kuvan verkostosta yksinkertaisen hierarkian sijaan]]
 
Vuonna 2010 julkaistiin muodollinen testi universaalista yhteisestä esivanhemmuudesta. Tämä perustui "niihin erittäin moneen molekyylisekvenssiin, jotka ovat nykyisin saatavilla elämän jokaisesta kunnasta".<ref name="Steel">{{lehtiviite |Tekijä=Steel M, Penny D |Otsikko=Origins of life: Common ancestry put to the test |Julkaisu=Nature |Vuosikerta=465 |Numero=7295 |Sivut=168–9 |Ajankohta=toukokuu 2010 |Pmid=20463725 |Doi=10.1038/465168a |Bibcode=2010Natur.465..168S |Kieli={{en}} }}</ref> Muodollinen testi suosi LUA:n olemassaoloa yli monen,laajan kirjon horisontaalisia geeninsiirtymiä sisältävien hypoteesiensisältäviä kirjoonhypoteesejä. Vaikka muodollinen koettelu suosi ylivoimaisesti sitä, että olisi ollut yksittäinen LUA, tämä ei kuitenkaan tarkoita, että LUA olisi koskaan ollut yksin. Se oli sen sijaan yksi useasta aikaisesta mikrobista.<ref name="theobald"/> Kuitenkin on lähestulkoon varmaa, että kaikilla organismeilla on yksi yhteinen esivanhempi koska monet muut nukleotidit ovat mahdollisia DNA:ssa ja RNA:ssa nykyisin käytettyjen nukleotidien lisäksi. Olisi erittäin epätodennäköistä, että erilaisista alkusoluista poikineet organismit kykenisivät suorittaa horisontaalisia geeninsiirtoja ilman, että ne sekoittaisivat toistensa geenejä tuottaen [[tilke-DNA]]:ta. Lisäksi on lukuisia aminohappoja, jotka ovat kemiallisesti mahdollisia niiden 20 lisäksi, joita nykyisin käytetään proteiineissa. Theobaldin suorittama muodollinen tilastollinen testi otti nämä kemialliset todisteet huomioon. Ne viittaavat siihen, että vaikka muita aikaisia mikrobeja varmaan oli olemassa, yksi ainut solu oli LUA koska muiden mikrobien jälkeläisiä ei selviytynyt Paleoarkeeista maailmankautta pidemmälle. AT/GC –säännön ja kahdenkymmenen aminohapon asettamalla yhteisellä kehyksellä, horisontaaliset geeninsiirrot olisivat olleet mahdollisia ja olisivat voineet olla erittäin yleisiä yksittäisen solun jälkeläisten keskuudessa.
 
Vuonna 1998 Carl Woese ehdotti, ettei yhtäkään yksittäistä organismia voisi ajatella LUA:na ja että kaikkien modernien organismien geneettinen materiaali periytyi muinaisessa organismien yhteisössä tapahtuneesta horisontaalisesta geeninsiirrosta.<ref>{{lehtiviite |Tekijä=Woese C |Otsikko=The universal ancestor |Julkaisu=Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America |Vuosikerta=95 |Numero=12 |Sivut=6854–9 |Ajankohta=kesäkuu 1998 |Pmid=9618502 |Pmc=22660 |Doi=10.1073/pnas.95.12.6854 |Bibcode=1998PNAS...95.6854W |Kieli={{en}} }}</ref> Vaikka myöhemmin julkaistujen tutkimusten tulokset viittaavat yksittäisen LUA:n olemassaoloon, Woesen esittämä perustelu pätee edelleen ns. ur-organismeihin. Elämän alkuvaiheissa polveutuminen ei ollut yhtä lineaarista kuin nykyisin koska geneettisen koodin kehittyminen vei aikaa.<ref name="majortransinevolution">{{Kirjaviite | Tekijä = Maynard Smith, John; Szathmáry, Eörs | Nimeke =The Major Transitions in Evolution | Vuosi =1995 | Luku = | Sivu = | Selite = | Julkaisupaikka =Oxford, Englanti | Julkaisija =Oxford University Press | Isbn = 0-19-850294-X | www =https://books.google.com/books?id=UGCmIVB5dhMC | www-teksti = | Tiedostomuoto = | Viitattu = 14.9.2016 | Kieli = }}</ref>{{lähde tarkemmin}} Organismeja ei voitu helposti kartoittaa fylogeneettiseen puuhun ennen korkeatasoista replikaatiota. LUA eli geneettisen koodin mukaan ja sillä oli kehittynyt ainakin jonkinlainen yksinkertainen molekyläärinen oikolukumekanismi. LUA ei ollut ihan ensimmäinen solu, mutta se oli sen sijaan se solu, jonka jälkeläiset selviytyivät mikrobievoluution ensimmäisten vaiheiden ohi.