Vaatimattoman pelaajauransa jälkeen Lagerbäck aloittisiirtyi valmentajaksi. Hän luotsasi uransa alussa eri seuroja Ruotsin maajoukkueenalasarjoisssa, valmennusryhmässäkunnes vuonna 1990 siirtyi Ruotsin jalkapalloliiton palvelukseen. Hän valmensi Ruotsin poikamaajoukkueitta ja vuosina 1994-1997 alle 21-vuotiaita yhdessä [[Tommy Söderberg]]in kakkosvalmentajanakanssa.<ref>[http://www.aftonbladet.se/sportbladet/article10842488.ab Startsidan / Sportbladet 2006-06-18 ETT UNDERVERK FRÅN OVANSJÖ]</ref> Hän valmensi myös Rotsin B-maajoukkuetta, kunnes siirtyi Södebergin apuvalmentajaksi [[Ruotsin jalkapallomaajoukkue|A-maajoukkueeseen]] vuonna 1998. Vuosina 2000–2004 Lagerbäck ja Söderberg jakoivat Ruotsin valmennusvastuun. He johdattivat maan [[Jalkapallon maailmanmestaruuskilpailut 2002|vuoden 2002 MM-kisoihin]] ja [[Jalkapallon Euroopan-mestaruuskilpailut 2004|vuoden 2004 EM-kisoihin]]. Vuodesta 2004 lähtien Lagerbäck on toiminut Ruotsin päävalmentajana yksin. Hän on johdattanut maan [[Jalkapallon maailmanmestaruuskilpailut 2006|vuoden 2006 MM-kisoihin]] ja [[Jalkapallon Euroopan-mestaruuskilpailut 2008|vuoden 2008 EM-kisoihin]].
Lagerbäckillä on takana vahva Ruotsin jalkapalloliiton tuki, sillä ennen EM-kisoja 2008 hän teki jatkosopimuksen vuoteen 2010. EM-kisojen päätyttyä jo alkulohkovaiheeseen, on Ruotsissa herännyt rajua kritiikkiä kahdeksan vuotta maajoukkuevalmentajana toiminutta Lagerbäckiä kohtaan. <ref>[http://www.svt.se/svt/jsp/Crosslink.jsp?d=85945&a=1178036&lid=puff_1177556&lpos=rubrik SVT:Kritiken hård mot Lars Lagerbäck]</ref> Lagerbäck itse on tyrmännyt häneen ja apuvalmentaja [[Roland Andersson]]iin kohdistuvan kritiikin ja todennut useaan otteeseen, että jatkaa sopimuksensa 2010 loppuun saakka Ruotsin maajoukkuevalmentajana. <ref>[http://www.yle.fi/urheilu/tapahtumat/jalkapallon_em_2008/lagerback_ei_aio_jattaa_ruotsin_maajoukkuetta_111458.html YLE:Lagerbäck ei aio jättää Ruotsin maajoukkuetta]</ref>