Jaavantiikerit olivat [[bengalintiikeri]]in ja [[siperiantiikeri]]in verrattuna pienikokoisia,<ref name="Mue"/> mutta [[sumatrantiikeri]]ä hieman suurempia.<ref name="zoo"/> Urosten paino oli 110–140 kiloa ja pituus häntä mukaan lukien 2,5 metriä. Naaraiden paino oli 75–115 kiloa, ja ne olivat uroksia 20–3020–30cm lyhyempiä. Karvoitus on tiheää ja lyhyttä.<ref name="Mue">{{Kirjaviite | Tekijä= Koivisto, I., & Sarvala, M. & Liukko, U-M. | Nimike=Maailman uhanalaiset eläimet – Osa 2: Nisäkkäät | Sivu =243 | Julkaisija=Weilin + Göös | Vuosi=1991 | Tunniste=ISBN 951-35-4687-X }}</ref> Alalajin väritys muistutti suuresti sumatrantiikerin ja [[balintiikeri]]n väritystä.<ref name="zoo">{{Kirjaviite | Tekijä=Lahti, S. (toim.) | Nimike=Zoo Suuri eläinkirja 1: Nisäkkäät | Sivu=298 | Julkaisija=WSOY | Vuosi=1977 | Tunniste=ISBN 951-0-08246-5}}</ref> Selän karvapeite oli ruosteenruskea, vatsapuolelta ruskeankeltaista. Juovat olivat hyvin kapeita, usein haaroittuneita tai pilkuista rakentuneita.<ref name="Mue"/> Sumatrantiikeriin verrattuna niiden juovat olivat tummempia ja tiheämpiä. Lisäksi [[viiksikarva]]t olivat pidemmät kuin millään muulla tiikerin alalajilla.<ref name="Maas">{{Verkkoviite | Tekijä=Peter Maas | Nimeke=Recently Extinct Animals – Species Info – Javan Tiger | Osoite=http://www.petermaas.nl/extinct/speciesinfo/javantiger.htm | Ajankohta=15.12.2007 | Julkaisija=The Extinction Website | Viitattu=30.12.2010}}</ref> Jaavantiikerin erotti muista tiikereistä edellä mainittujen piirteiden ohella myös [[takaraivonluu]]ssa olevan selvästi havaittavan kavennuksen perusteella.<ref name="Mue"/>
