''Lego Harry Potterin'' pelaaminen vastaa pääpiirteiltään aikaisempien Lego pelien pelaamista. Loitsut ovat tärkeässä osassa ''Lego Harry Potterin'' pelaamista, ja pelissä on useita loitsuja joita voi oppia pelin edetessä. Koska pelissä on useita loitsuja, voi pelaaja valita valikosta mitä loitsua käyttää. Taikajuomat ovat myös tärkeässä osassa pelissä. Taikajuomat voivat auttaa tasojen läpäisemisessä, tai jos ne on valmistetu väärin niissä voi olla ikäviä sivuvaikutuksia, kuten pelaajan muuttuminen sammakoksi. Pelissä on useita hahmoja ja paikkoja, sillä se kattaa viimeiset kolme kirjaa kirjasarjasta ja viimeiset neljä elokuvaa.<ref name="GI">{{cite web|url=http://www.gameinformer.com/b/news/archive/2011/05/19/harry-potter-saga-to-conclude-in-lego-form.aspx |title=Harry Potter Saga To Conclude In LEGO Form - News - www.GameInformer.com |publisher=GameInformer |first=Jeff |last= Cork |date=2011-05-19|accessdate=2011-05-19}}</ref> Pelissä on ''[[Lego Indiana Jones 2: The Adventure Continues]]issa'' ensimmäistä kertaa nähty moninpelimekaniikka.
