Kaikki Sm1-yksiköt on saneerattu 1990-luvulla ja ne ovat siten VR:n silloisissa punavalkoisissa väreissä. Ensimmäinen, vuonna 1994 saneerattu yksikkö oli 6006/6206, joka poikkeaa ratkaisuiltaan myöhemmin saneeratuista malleista. Sen maalaus oli saneerauksesta huolimatta pysynyt punakeltaisena, ja siihen oli asennettu ulostyöntyvillä astinlaudoilla varustetut uudenlaiset ovetliukuovet. Lisäksi eteisten ja matkustajaosastojen väliset heiluriovet oli korvattu sähkötoimisilla liukuovilla. Saneerattu 6006/6206 liikennöi [[M-juna|M-linjalla]] koekäytössä vuosina 1994–1996, sillä Vantaankosken rata oli tuolloin ainoa, jossa oli koejunan ovien vaatimat korkeat laiturit kaikilla liikennepaikoilla. Koekäytön jälkeen saneeraus aloitettiin laajamittaisena, ja ensimmäiset punavalkoiseksi maalatut, saneeratut Sm1-rungot saatiin liikenteeseen alkuvuonna 1996. Niihin oli koejunasta poiketen asennettu normaalit ovethaitariovet portaineen, eikä sisätilojen väliovia muutettu. Saneerauksen myötä yksiköiden sisusta peruskorjattiin täysin, ja vanhat matkatavaraosastot muutettiin matkustajaosastoiksi. Myös junan ohjaamot uudistettiin täysin ja niihin asennettiin ilmastointi. Hieman muusta sarjasta ulkonäöltään eronneet, ns. protosarjan yksiköt (6001/6201–6005/6205) muutettiin saneerauksen myötä muiden sarjan junien kaltaisiksi. Viimeinen saneerattu Sm1-yksikkö on 6026/6226, joka otettiin takaisin liikenteeseen syksyllä 2000.<ref>[http://www.raitio.org/vrlahi/saneer.htm SRS: Sm-junien saneeraus]</ref>
==Tulevaisuus==
Ensimmäinen hylätty Sm1-yksikkö 6008/6208 vaurioitui 2009 Riihimäellä vaihtoliikkeen mentyä pitkäksi ja junan ajettua [[Raiteensulku|raiteensulun]] yli, eikä sitä korjattu enää takaisin ajokuntoon. 6008/6208 seisoi jonkun aikaa VR:n Hyvinkään konepajalla, jossa sitä pidettiin varaosalähteenä vielä käytössä oleville sarjansa junille. Se hylättiin lokakuussa 2009 ja on sittemmin romutettu. LokakuussaLokakuuhun 2014 mennessä kaikki jäljellä olevat Sm1-junat yksikköön 6021/6221 saakka poistettiin liikenteestä ja junat ovat olleet varaosalähteinä Hyvinkään konepajalla ennen siirtymistä romutukseen. Tammikuussa 2015 liikenteessä oli enää yhteensä 20 Sm1-yksikköä: 6022/6222, 6023/6223, 6027/6227–6030/6230, 6032/6232, 6034/6234, 6036/6236, 6037/6237 ja 6041/6241–6050/6250.
VR:llä ei vielä ole riittävästi korvaavaa kalustoa kaikkien Sm1-junien tilalle, mutta sarjan hylkäys on aloitettu uusien [[Sm5]]-lähijunien tultua liikenteeseen vuodesta 2009 lähtien. Sm1-junien suunnitellaan poistuvan käytöstä viimeistään koko Sm5-sarjan tultua liikenteeseen kesään 2017 mennessä. Yksikkö 6001/6201 on varattu Rautatiemuseolle.
