Fosfoenolipuryvaattikarboksikinaasi voidaan jakaa kahteen ryhmään entsyymin sijainnin mukaan. Entsyymiä on [[mitokondrio]]issa ja [[sytosoli]]ssa esiintyvät muodot. [[Kyyhkyt|Kyyhkyjen]], [[kana|kanojen]] ja [[kani]]en maksassa esiintyvä fosfoenolipuryvaattikarboksikinaasi on mitokondrionaalista muotoa ja [[hiirikotihiiri]]llä ja [[rotta|rotilla]] entsyymiä on vain sytosolissa. [[Ihminen|Ihmisillä]], [[marsu]]illa ja [[lehmä|lehmillä]] entsyymiä on yhtä paljon sekä mitokondrioissa että sytosolissa. Sytosolinen ja mitokondrionaalinen muoto eroavat rakenteeltaan, immunologisilta ominaisuuksiltaan ja kinetiikaltaan.<ref>{{Kirjaviite | Tekijä =Robert K. Murray | Nimeke =Harper's illustrated biochemistry | Vuosi =2003 | Sivu =153 | Julkaisija =McGraw-Hill Professional | Tunniste =ISBN 978-0071389013 | www =http://books.google.fi/books?id=aNmgMg2L_FIC&pg=PA153&dq=Phosphoenolpyruvate+carboxykinase&cd=7#v=onepage&q=Phosphoenolpyruvate%20carboxykinase&f=false | www-teksti =Kirja Googlen teoshaussa | Viitattu = 14.12.2009 | Kieli ={{en}}}}</ref><ref>{{Kirjaviite | Tekijä =Klaus Urich | Nimeke =Comparative animal biochemistry | Vuosi =1994 | Sivu =692 | Julkaisija =Springer | Tunniste =ISBN 978-3-540-57420-0 | www =http://books.google.fi/books?id=GLbcWyeaCGQC&pg=PA692&dq=Phosphoenolpyruvate+carboxykinase+%2B+isoenzyme&lr=&cd=46#v=onepage&q=&f=false | www-teksti =Kirja Googlen teoshaussa | Viitattu = 14.12.2009 | Kieli ={{en}}}}</ref>
