Ero sivun ”Sitraattisyntaasi” versioiden välillä
[katsottu versio] | [katsottu versio] |
Poistettu sisältö Lisätty sisältö
pEi muokkausyhteenvetoa |
p typo |
||
Rivi 3:
==Rakenne ja mekanismi==
Sitraattisyntaasi esiintyy eliöiden soluissa [[mitokondrio]]iden matriisissa. Nisäkkäillä entsyymi on [[dimeeri]] eli koostuu kahdesta yksiköstä, jotka ovat keskenään samanlaisia. Kooltaan yksiköt ovat 49 [[Dalton|kDa]]. Eräillä muilla eliöillä entsyymi voi koostua kuudesta yksiköstä, jolloin se on heksameeri.<ref name="Biochemistry" /><ref name="MM">{{Kirjaviite | Tekijä =David E. Metzler, Carol M. Metzler | Nimeke =Biochemistry: the chemical reactions of living cells | Vuosi =2001 | Sivu =701 | Julkaisija =Academic Press | Tunniste =ISBN 978-0-12-492540-3 | www =http://books.google.fi/books?id=v9HL5VyRmZcC&pg=PA701&dq=Citrate+synthase&hl=fi&ei=PwwwTtfnKpDNswbLx7HxDw&sa=X&oi=book_result&ct=result&resnum=10&ved=0CFgQ6AEwCTgU#v=onepage&q=Citrate%20synthase&f=false | www-teksti =Kirja Googlen teoshaussa | Viitattu = 27.07.2011 | Kieli ={{en}}}}</ref><ref name="Mitochondria">{{Kirjaviite | Tekijä =Liza A. Pon, Eric A. Schon | Nimeke =Mitochondria | Vuosi =2007 | Sivu =207 | Julkaisija =Academic Press | Tunniste =ISBN 9780125441735 | www =http://books.google.fi/books?id=dYKC0YyqKhMC&pg=PA207&dq=Citrate+synthase&hl=fi&ei=-gswTueaFIO6-Aa8qvmJBA&sa=X&oi=book_result&ct=result&resnum=1&ved=0CCcQ6AEwADgK#v=onepage&q=Citrate%20synthase&f=false | www-teksti =Kirja Googlen teoshaussa | Viitattu = 27.07.2011 | Kieli ={{en}}}}</ref>
Oksaalietikkahappo sitoutuu avoimeen inaktiivseen entsyymiin. Sitoutumisen seurauksena entsyymin konformaatio muuttuu, alayksiköt siirtyvät lähemmäs toisiaan noin 15 [[Ångström|Å]]:n verran. Kummassakin yksikössä on myös pienempi alayksikkö joka pyörähtää 19 astetta. Tällöin sitraattisyntaasiin muodostuu sitoutumiskohta myös koentsyymi-A:lle. Sitraattisyntaasi tuo substraatit lähelle toisiaan, asettaa ne oikeaan asemaan ja polarisoi eräitä sidoksia. Aktiivisessa kohdassa [[asparagiinihappo]] toimii emäksenä ja poistaa asetyylikoentsyymi-A:n hiiliatomilta protonin ja [[histidiini]] luovuttaa protonin asetyylikoentsyymi-A:n karbonyyliryhmän hapelle, jolloin muodostuu [[enoli]]. Toinen histidiini aktivoi oksaloasetaattimolekyylin luovuttamalla sen karbonyyliryhmälle protonin. Enolisoitunut asetyylikoentsyymi-A on nukelofiili ja hyökkää oksaloetikkahappoon, reaktio on tyypiltään [[aldolikondensaatio]]. Näin muodostuu välituotteena sitryylikoentsyymi-A. Hydrolyysin jälkeen sitruunahappo- ja koentsyymi-A-
[[Kuva:Citrate synthase Closed form.png|thumb|250px|Sitraattisyntaasi aktiivisessa sulkeutuneessa konformaatiossa]]
Se mistä suunnasta koentsyymi-A hyökkää oksaloetikkahapon karbonyyliryhmään määrittää mitä sitruunahapon stereoisomeeria reaktiossa muodostuu. Nisäkkäillä ja [[kolibakteeri]]lla hyökkäys tapahtuu Si-puolelta, jolloin tuotteella on S-konfiguraatio.
Sitraattisyntaasin pääasiallinen säätelytekijä on substraattien määrä. Sitä aktivoivat allosteerisesti [[kalsium]]ionit ja [[adenosiinidifosfaatti|ADP]]-molekyyli. [[Inhibiittori|Inhibiittoreita]] ovat muun muassa sitruunahappo, [[Adenosiinitrifosfaatti|ATP]], [[sukkinyylikoentsyymi-A]], rasvahappojen koentsyymi-A-johdannaiset ja [[NAD+|NADH]]. Sitraattisyntaasiaktiivisuutta voidaan käyttää mittarina tutkittaessa mitokondrioiden vahingoittumista esimerkiksi solujen ultraäänisärkemisen tai pakastekuivauksen yhteydessä.<ref name="brenda" /><ref name="Mitochondria" /><ref name="CHF">{{Kirjaviite | Tekijä =Pamela C. Champe, Richard A. Harvey, Denise R. Ferrier | Nimeke =Biochemistry | Vuosi =2008 |Sivu =109 | Julkaisija =Lippincott Williams & Wilkins | Tunniste =ISBN 978-0-7817-6960-0 | www =http://books.google.fi/books?id=M_YOW50cg9oC&pg=PA109&dq=Citrate+synthase&hl=fi&ei=7Q0wTsOqJdDKsgbL4u0X&sa=X&oi=book_result&ct=result&resnum=3&ved=0CDEQ6AEwAjiMAQ#v=onepage&q=Citrate%20synthase&f=false | Viitattu =27.07.2011 | Kieli ={{en}}}}</ref>
==Lähteet==
|