Ero sivun ”DNA-profilointi” versioiden välillä

[arvioimaton versio][arvioimaton versio]
Poistettu sisältö Lisätty sisältö
profilointi kuvaavampi käsite?
järjestely
Rivi 1:
[[Tiedosto:CBP chemist reads a DNA profile.jpg|thumb|Varhaisaikojen DNA-profilointia]]
{{korjattava/painotus|Todella äärimmäisen homosentrinen. Tätähän käytetään suunnilleen minkä tahansa ameeban tutkimuksessa.}}
'''DNA-profilointi''' (myös ''geenitesti'', ''DNA-testi'', ''geneettinen sormenjälkitutkimus'') tarkoittaa tekniikoita, jollajoilla eliöyksilön identiteetti määritetään sen [[kudos|kudoksesta]] tai [[erite|eritteestä]] otetusta näytteestä eristetyn [[DNA]]:n perusteella. Profilointi perustuu yksilöiden välisiin DNA:n rakenteen eroihin, joita nykyisillä menetelmillä voidaan löytää lähes rajaton määrä, jolloin jokainen yksilö voidaan kiistattomasti erotella. DNA-testeillä voidaan esimerkiksi selvittää sukulaisuussuhteita ja periytymistä. DNA-testi hyväksytään useimmissa maissa todisteeksi oikeudenkäyntiprosesseissa, ja DNA-testit ovat syrjäyttämässä [[sormenjälki|sormenjäljet]] henkilöllisyyden varmistamisessa luotettavuutensa takia.<ref>{{Verkkoviite | Osoite=http://yle.fi/uutiset/kotimaa/2010/06/dna-naytteet_syrjayttavat_sormenjaljet_rikostutkinnassa_1745997.html?origin=rss | Nimeke = DNA-näytteet syrjäyttävät sormenjäljet rikostutkinnassa | Julkaisija = YLE | Ajankohta = 9.6.2010}}</ref>
[[Tiedosto:CBP chemist reads a DNA profile.jpg|thumb]]
{{Tämä artikkeli| käsittelee näytteen ja yksilön DNA:n vertailua. Eläinlajin koko genomin kartoitus on artikkelissa [[genomi]].}}
'''DNA-profilointi''' (myös ''geenitesti'', ''DNA-testi'', ''geneettinen sormenjälkitutkimus'') tarkoittaa tekniikoita, jolla eliöyksilön identiteetti määritetään sen [[kudos|kudoksesta]] tai [[erite|eritteestä]] otetusta näytteestä eristetyn [[DNA]]:n perusteella. Profilointi perustuu yksilöiden välisiin DNA:n rakenteen eroihin, joita nykyisillä menetelmillä voidaan löytää lähes rajaton määrä, jolloin jokainen yksilö voidaan kiistattomasti erotella. DNA-testeillä voidaan esimerkiksi selvittää sukulaisuussuhteita ja periytymistä. DNA-testi hyväksytään useimmissa maissa todisteeksi oikeudenkäyntiprosesseissa, ja DNA-testit ovat syrjäyttämässä [[sormenjälki|sormenjäljet]] henkilöllisyyden varmistamisessa luotettavuutensa takia.<ref>{{Verkkoviite | Osoite=http://yle.fi/uutiset/kotimaa/2010/06/dna-naytteet_syrjayttavat_sormenjaljet_rikostutkinnassa_1745997.html?origin=rss | Nimeke = DNA-näytteet syrjäyttävät sormenjäljet rikostutkinnassa | Julkaisija = YLE | Ajankohta = 9.6.2010}}</ref>
 
Vastaavia tekniikoita voidaan käyttää myös karkeammin lajitasolla eliölajien määrittämiseen [[DNA-viivakoodaus]]-tekniikalla.
== YleistäMenetelmät ==
Ensimmäisen DNA-sormenjälkitekniikan kehitti Sir Alec Jeffreys Leicesterin yliopistosta vuonna 1985. Tämä perustui minisatelliiteiksi kutsuttuihin suhteellisen pitkiin toistojaksoihin, joiden lukumäärä vaihtelee runsaasti eri yksilöiden (ja näiden [[kromosomi]]en) välillä. TutkimallaKun tutkitaan useita merkkilokuksia, on äärimmäisen epätodennäköistä, että kahdella yksilöllä olisi täysin samanlainen täysin minisatellittien yhdistelmä.<ref>[http://archive.sciencewatch.com/interviews/sir_alec_jeffreys.htm Sir Alec Jeffreys on DNA Profiling and Minisatellites] Science Watch 2008</ref><ref>{{Verkkoviite | Osoite=http://www2.le.ac.uk/ebulletin/news/press-releases/2000-2009/2005/09/nparticle-kv8-487-wdd | Nimeke = Sir Alec Jeffreys wins Lasker Award | Julkaisija = University of Leicester | Ajankohta = 2005}}</ref> Nykyisin minisatelliittitutkimuksen ovat DNA-profiloinnissa korvanneet useat muut, yleensä [[PCR]]-tekniikkaan ja hypervaihteleviin geenialueisiin perustuvat tekniikat.
 
Minisatellitit ja eräät muut aiemmin rikostutkimuksessa käytetyt metodit perustuivat [[RFLP-analyysi]]in (''restriction fragment length polymorphism''). Uudemmat menetelmät perustuvat yleensä [[PCR|PCR-tekniikkaan]] (''polymerase chain reaction''). Tärkeimipiä menetelmiä ovat olleet [[mikrosatelliitti (biologia)|mikrosatellliitteihin]] perustuva [[STR-analyysi]] (''short tandem repeats'') sekä nykyisin käytetty [[SNP]]-merkkeihin perustuvaa profilointi. Vaikka yksittäisten SNP-lokusten vaihtelevuus on rajallinen, niiden suuri lukumäärä kompensoi tilanteen.
DNA-testiä käytetään usein oikeustapauksissa verrattaessa rikospaikkalöydöksiä epäiltyjen veri-, hius-, sylki- ja siemennestenäytteisiin. Testaus on johtanut myös useisiin tuomittujen epäiltyjen vapauttamiseen jälkikäteen. Muita käyttötarkoituksia ovat ruumiiden tunnistaminen, isyystestig, elinluovutuksen varmistus, villieläinten populaatioiden tutkiminen sekä ruoan alkuperän tai koostumuksen selvittäminen.<ref name="HGP"/> Vastaavia tekniikoita käytetään jäljitettäessä ihmisen ja muiden lajien leviämishistoriaa esihistoriallisena ja historiallisena aikana.<ref>[http://suomenkuvalehti.fi/jutut/ulkomaat/muinainen-pieni-sormi-paljasti-ennen-tuntemattoman-esi-ihmisen Muinainen pieni sormi paljasti ennen tuntemattoman esi-ihmisen] Suomen Kuvalehti 2010</ref><ref>[http://www.orkneyjar.com/history/vikingorkney/genetics.htm The blood of the vikings - Orkney's genetic heritage] Orkneyjar</ref><ref>[http://news.bbc.co.uk/2/hi/uk_news/england/1689955.stm Viking blood still flowing] BBC 2001</ref> Esimerkiksi koiran kesyttämisestä on hankittu tietoja vertailemalla DNA-näytteistä erirotuisista koirista ja susista ympärim maailmaa.<ref>[http://www.mnh.si.edu/GeneticsLab/StaffPage/MaldonadoJ/PublicationsCV/Science_Dog_Paper.pdf Multiple and Ancient Origins of the Domestic Dog] Science 1997</ref>
 
AikaisemminErityistapauksissa käytetään suosituin metodi oli [[RFLP-analyysi]] (''restriction fragment length polymorphism''), joka oli yksi ensimmäisistä rikostutkimuksen käyttöön kehitetyistä. Muita tekniikoita ovat [[PCR|PCR-analyysi]] (''polymerase chain reaction''), AFLP (''amplified fragment length polymorphism''), [[mikrosatelliitti (biologia)|mikrosatellliitteihin]] perustuva [[STR-analyysi]]poikkeavasti (''shortperiytyviä tandemgenomin repeats'')osia, [[Y-kromosomi]]-analyysianalyysia sekä [[mitokondrio]]-DNA-analyysianalyysia. Y-kromosomit periytyvät isältä pojille, mitokondrio äidiltä kaikille lapsille. Näitä käytetään esimerkiksi onnettomuuden uhrien tunnistamisessa.<ref name="HGP">{{Verkkoviite | Osoite=http://www.ornl.gov/sci/techresources/Human_Genome/elsi/forensics.shtml | Nimeke = DNA Forensics | Julkaisu = Human Genome Porject Information}}</ref> Mitokondrio-analyysiä käytetään myös pitkälle hajonneiden näytteiden tapauksessa, koska mtDNA:ta on soluissa enemmän kuin muita merkkigeenejä. Nykyisin käytetään [[SNP]]-merkkeihin perustuvaa profilointia. Vaikka yksittäisten SNP-lokusten vaihtelevuus on rajallinen, niiden suuri lukumäärä kompensoi tilanteen.
Testaus on yleensä vapaaehtoista,{{selvennä}} mutta sille voidaan asettaa lainvoima etsinnöissä tai virkavallan määräyksestä. Useat maat ovat alkaneet koota tietopankkeja tuomittujen henkilöiden DNA:sta. Esimerkiksi Yhdysvalloilla oli vuonna 2011 maailman laajin DNA-tietokanta, nimeltään ''Combined DNA Index System'' (CODIS), jossa oli lähes kymmenen miljoonaa näytettä.<ref>{{Verkkoviite | Osoite= http://www.fbi.gov/about-us/lab/codis/ndis-statistics | Nimeke = CODIS—NDIS Statistics | Julkaisija = FBI | Viitattu = 7.9.2011}}</ref> Tämä on herättänyt keskustelua paikallisissa ihmisoikeusjärjestöissä, erityisesti miten laajat valtuudet poliisilla on ottaa näyte.<ref>[http://www.guardian.co.uk/politics/2009/aug/07/dna-database-police-advice Police told to ignore human rights ruling over DNA database] Guardian 2009</ref>
==Käyttö==
DNA-testiä käytetään usein oikeustapauksissa verrattaessa rikospaikkalöydöksiä epäiltyjen näytteitä rikospaikalta saatuihin veri-, hius-, sylki- jata siemennestenäytteisiin. Testaus on johtanut myös useisiin tuomittujen epäiltyjen vapauttamiseen jälkikäteen. Muita käyttötarkoituksia ovat ruumiiden tunnistaminen, isyystestig[[isyystesti]]t, elinluovutuksen varmistus, villieläinten populaatioiden tutkiminen sekä ruoan alkuperän tai koostumuksen selvittäminen.<ref name="HGP"/> Vastaavia tekniikoita käytetään jäljitettäessä ihmisen ja muiden lajien leviämishistoriaa esihistoriallisena ja historiallisena aikana.<ref>[http://suomenkuvalehti.fi/jutut/ulkomaat/muinainen-pieni-sormi-paljasti-ennen-tuntemattoman-esi-ihmisen Muinainen pieni sormi paljasti ennen tuntemattoman esi-ihmisen] Suomen Kuvalehti 2010</ref><ref>[http://www.orkneyjar.com/history/vikingorkney/genetics.htm The blood of the vikings - Orkney's genetic heritage] Orkneyjar</ref><ref>[http://news.bbc.co.uk/2/hi/uk_news/england/1689955.stm Viking blood still flowing] BBC 2001</ref> Esimerkiksi koiran kesyttämisestä on hankittu tietoja vertailemalla DNA-näytteistä erirotuisista koirista ja susista ympärim maailmaa.<ref>[http://www.mnh.si.edu/GeneticsLab/StaffPage/MaldonadoJ/PublicationsCV/Science_Dog_Paper.pdf Multiple and Ancient Origins of the Domestic Dog] Science 1997</ref>
 
Testaus on yleensä vapaaehtoista,{{selvennä}} mutta sille voidaan asettaa lainvoima etsinnöissä tai virkavallan määräyksestä. Useat maat ovat alkaneet koota tietopankkeja tuomittujen henkilöiden DNA:sta. Esimerkiksi Yhdysvalloilla oli vuonna 2011 maailman laajin DNA-tietokanta, nimeltään ''Combined DNA Index System'' (CODIS), jossa oli lähes kymmenen miljoonaa näytettä.<ref>{{Verkkoviite | Osoite= http://www.fbi.gov/about-us/lab/codis/ndis-statistics | Nimeke = CODIS—NDIS Statistics | Julkaisija = FBI | Viitattu = 7.9.2011}}</ref> Tämä on herättänyt keskustelua paikallisissa ihmisoikeusjärjestöissä, erityisesti miten laajat valtuudet poliisilla on ottaa näyte.<ref>[http://www.guardian.co.uk/politics/2009/aug/07/dna-database-police-advice Police told to ignore human rights ruling over DNA database] Guardian 2009</ref>
== Menetelmät ==
Aikaisemmin suosituin metodi oli [[RFLP-analyysi]] (''restriction fragment length polymorphism''), joka oli yksi ensimmäisistä rikostutkimuksen käyttöön kehitetyistä. Muita tekniikoita ovat [[PCR|PCR-analyysi]] (''polymerase chain reaction''), AFLP (''amplified fragment length polymorphism''), [[mikrosatelliitti (biologia)|mikrosatellliitteihin]] perustuva [[STR-analyysi]] (''short tandem repeats''), [[Y-kromosomi]]-analyysi sekä [[mitokondrio]]-DNA-analyysi. Y-kromosomit periytyvät isältä pojille, mitokondrio äidiltä kaikille lapsille. Näitä käytetään esimerkiksi onnettomuuden uhrien tunnistamisessa.<ref name="HGP">{{Verkkoviite | Osoite=http://www.ornl.gov/sci/techresources/Human_Genome/elsi/forensics.shtml | Nimeke = DNA Forensics | Julkaisu = Human Genome Porject Information}}</ref> Mitokondrio-analyysiä käytetään myös pitkälle hajonneiden näytteiden tapauksessa, koska mtDNA:ta on soluissa enemmän kuin muita merkkigeenejä. Nykyisin käytetään [[SNP]]-merkkeihin perustuvaa profilointia. Vaikka yksittäisten SNP-lokusten vaihtelevuus on rajallinen, niiden suuri lukumäärä kompensoi tilanteen.
 
== Kotieläinten DNA-tutkimukset ==