Aikaisemmin suosituin metodi oli [[RFLP-analyysi]] (''restriction fragment length polymorphism''), joka oli yksi ensimmäisistä rikostutkimuksen käyttöön kehitetyistä. Muita tekniikoita ovat [[PCR|PCR-analyysi]] (''polymerase chain reaction''), AmpFLP (''amplified fragment length polymorphism''), edellämainitussa FMI:n tietokannassa käytetty STR -analyysi (''short tandem repeats''), y-kromosomi -analyysi sekä mitokondrio -analyysi. Y-kromosomit periytyvät isältä pojille, mitokondrio äidiltä kaikille lapsille. Näitä käytetään esimerkiksi onnettomuuden uhrien tunnistamisessa.<ref name="HGP">{{Verkkoviite | Osoite=http://www.ornl.gov/sci/techresources/Human_Genome/elsi/forensics.shtml | Nimeke = DNA Forensics | Julkaisu = Human Genome Porject Information}}</ref> Mitokondrio-analyysiä käytetään myös erittäin vahingoittuneen dna-ketjun tapauksessa.
