Ksyleenisyanoli
kemiallinen yhdiste
Ksyleenisyanoli ( C25H27N2O6S2Na) on väriaine, jota käytetään muun muassa geelielektroforeesissa merkkiaineena. DNA:n sekvensoinnissa käytetään väriaineena usein ksyleenisyanolin lisäksi myös bromifenolisinistä. [4]
| Ksyleenisyanoli | |
|---|---|
 |
|
| Tunnisteet | |
| IUPAC-nimi |
Natrium 4-[(E)-[4-[2-[4-(etyyliamino)-3-metyylifenyyli]etyyliamino]-3- metyylisykloheksa-2,5-dien-1-ylideeni]metyyli]-3-sulfobentseenisulfonaatti |
| CAS-numero | |
| PubChem CID | |
| SMILES |
CCNC1=C(C=C(C=C1)CCN=C2C=CC(=CC3=C(C=C(C=C3)S(=O)(=O)[O-])S(=O)(=O)O)C= C2C)C.[Na+] [1] |
| Ominaisuudet | |
| Molekyylikaava | C25H27N2O6S2Na |
| Moolimassa | 538,616 g/mol |
| Liukoisuus veteen | 1 g/l [2] |
Liikkumisnopeus muokkaa
Ksyleenisyanolin liikkumisnopeus geelissä vaihtelee geelin pitoisuuden ja geelilaatujen perustella. Yleensä ksyleenisyanoli liikkuu 85–4 000 DNA-jakson verran. [5]
Muita käyttöjä muokkaa
Metyylioranssin ksyleenisyanoliliuos on pH-indikaattori. Se vaihtaa väriään violetista vihreäksi pH:n ollessa välillä 3,2–4,2. [6]
Lähteet muokkaa
- ↑ EINECS 220-167-5 – Substance summary NCBI. Viitattu 12. maaliskuuta 2009.
- ↑ Ksyleenisyanoli (PDF) VWR. Viitattu 12.3.2009. [vanhentunut linkki]
- ↑ Ksyleenisyanoli Käyttöturvallisuustiedote. 21.10.2016. Sigma Aldrich (Merck). Viitattu 30.5.2018. (suomeksi)
- ↑ DNA:n sekvenssointi Edu.fi. Opetushallitus. Arkistoitu 15.12.2007. Viitattu 12.3.2009.
- ↑ Terry Brown: Essential molecular biology, s. 100. Oxford University Press, 1999. ISBN 9780199636426. Kirja Googlen teoshaussa (viitattu 12.3.2009). (englanniksi)
- ↑ Liste des indicateurs colorés SBEC. Viitattu 12. maaliskuuta 2009.