Prosper Garnot (13. tammikuuta 1794 Brest, Ranska1838) oli ranskalainen lääkäri ja luonnontieteilijä.

Garnot toimi apulaiskirurgina Louis Isidore Duperreyn alaisuudessa La Coquillen maailmanympäripurjehduksella vuosina 1822–1825. René-Primevère Lessonin kanssa hän keräsi suuren määrän luonnonhistoriallisia näytteitä Etelä-Amerikasta ja Tyyneltämereltä. Garnot sairastui punatautiin ja hänet lähetettiin takaisin Castle Forbesilla, mukanaan osa näytteistä. Näytteet tuhoutuivat laivan haaksirikkouduttua Hyväntoivonniemen edustalla heinäkuussa 1824.

Garnot j aLessonin laativat retkestä eläintieteellisen selostuksen Voyage autour du monde exécuté par order du roi sur la corvette La Coquille (1828-1832). He nimesivät muun muassa atulapyrstökolibrin (Thaumastura cora).