Ero sivun ”Ligaasit” versioiden välillä

[arvioimaton versio][arvioimaton versio]
Poistettu sisältö Lisätty sisältö
Kuva
Λ (keskustelu | muokkaukset)
Korjataan ligaasin yleismääritelmä, DNA-ligaasi omaan alaosioon
Rivi 1:
[[Kuva:DNA Repair.jpg|thumb|250px|DNA-ligaasi korjaamassa vauriota kromosomissa]]
'''Ligaasi''' ({{la}} ''ligāre'' – "sitoa yhteen", "liimata yhteen") on [[entsyymi]] joka kykenee katalysoimaan kahden molekyylin yhteensitoutumisen luomalla uuden kemiallisen sidoksen, yleensä toisen kohdemolekyylin kemiallisen alaryhmän hydrolyysin avulla. Yleisesti ottaen ligaasi katalysoi seuraavan reaktion:
'''Ligaasi''' on [[entsyymi]] joka kykenee liittämään [[DNA]]-juosteita yhteen muodostamalla [[kovalenttinen sidos|kovalenttisia sidoksia]] juosteiden päiden välille. Toisessa yhteenliitettävässä päässä on oltava 5'-fosfaattiryhmä ja toisessa 3'-OH-ryhmä. Ligaasit ovat tärkeitä [[geenitekniikka|geenitekniikan]] työvälineitä ja yleisimmin käytettävä T4-ligaasi on peräisin ''[[Escherichia coli]]''-bakteerista.
 
:Ab + C → A–C + b
== Ligaasin toiminta ==
 
tai joskus
 
:Ab + cD → A–D + b + c
 
jossa pienet aakkoset kuvaavat kemiallisia alaryhmiä.
 
== DNA-ligaasi ==
'''Ligaasi''' on [[entsyymi]] joka kykenee liittämään [[DNA]]-juosteita yhteen muodostamalla [[kovalenttinen sidos|kovalenttisia sidoksia]] juosteiden päiden välille. Toisessa yhteenliitettävässä päässä on oltava 5'-fosfaattiryhmä ja toisessa 3'-OH-ryhmä. Ligaasit ovat tärkeitä [[geenitekniikka|geenitekniikan]] työvälineitä ja yleisimmin käytettävä T4-ligaasi on peräisin ''[[Escherichia coli]]''-bakteerista.
 
== LigaasinDNA-ligaasin toiminta ==
 
Kuvassa kaksi DNA-juostetta ennen ligaasin aiheuttamaa juosteiden yhteenliittymistä. Vapaat OH-ryhmät sijaitsevat punaisella merkityn juosteen ylemmän rihman oikeanpuolimmaisessa tymiinissä (T) ja sinisellä merkityn juosteen alemman rihman vasemmanpuolimmisessa sytosiinissa (C). Vastaavasti vapaat fosfaattiryhmät sijaitsevat punaisella merkityn juosteen alemman rihman oikeanpuolimmaisessa guaniinissa (G) ja sinisellä merkityn juosteen ylemman rihman vasemmanpuolimmaisessa guaniinissa.