Ero sivun ”Mario & Luigi: Bowser’s Inside Story” versioiden välillä

Nimestä jo voi päätelläkin, että pelissä Mario ja Luigi seikkailevat Bowserin sisällä. Tarina alkaa kun hirveä Blorbs-tauti saa Toadit paisumaan.Prinsessa Peach pitää hätä-kokouksen tästä taudista. Mutta mikään ei näytä toimivan, ja Bowser tulee jälleen kidnappaamaan prinsessan, mutta saa köniin Mariolta. Pahamaineinen Fawful yrittää vallata Sienivaltakunnan petkuttamalla Bowseria syömään taikasienen. Tämä sieni saa Bowserin hengittämään sisäänsä kaiken ympärillään, mukaan lukien Marion, Luigin sekä Prinsessa Peachin! Pystyvätkö Mario-veljekset pelastamaan Peachin ja pakenemaan? Pelissä pelataan sekä Bowserilla, että Mariolla ja Luigilla. Välillä Marion ja Luigin täytyy auttaa Bowseria sisältäpäin.