M.U.G.E.N:n mukana tulee vain yksi hahmo, Kung Fu Man, mutta käyttäjät ovat luoneet peliin on luotu useita hahmoja muun muassa monista tappelupeleistä kuten [[Tekken]]istä ja [[Mortal Kombat]]ista. Tämän lisäksi pelissä on myös monia muita peli- ja tv-hahmoja kuten [[Super Mario]], [[Homer Simpson]], Hassu-klovni, Turanga Leela, Bender Bendin Rodriques ja [[Sonic]] sekä supersankareita kuten [[Hämähäkkimies]], [[Lepakkomies]] ja [[Teräsmies]]. Dragon Claw on esimerkki hahmosta, joka on luotu varta vasten M.U.G.E.N:ia varten.
