|
Molekyylien välisiä eroja voidaan yrittää käyttää lajiutumisen ajoitukseen eli [[molekyylikello]]na. Molekyylien evoluutio ei ole kuitenkaan tapahtunut vakionopeudella, koska se riippuu ympäristöstä ja koska molekyylit eivät voi muuntua rajattomasti. Molekyyylievoluution tutkimus on edennyt kovasti 2000-luvulla, jolloin tuotiin esiille muun muassa geenien kehdentumisen merkitys molekyylievoluutioissa. Geenin kahdentuessa kahdeksi identtiseksi kopioksi toinen voi pysyä ennallaan ja toinen mutatoitua.
== Molekyylievoluution mekanismeista ==
[[Kuva:Zinc-finger-seq-alignment2.png|thumb|right|220px|kahden proteiinin aminnohapposarjat.]]
Molekyylievoluutioon voivat vaikuttaa seuraavat tekijät
*Ympäristön mutageenisuus: säteily, kemialliset olot
*DNA-pistemutaatiot
*DNA-korjausmekanismin mahdollinen pois kytkeytymninen mutaation takia
*DNA geenin ulkopuolella, "roska-dna" muuttuu joskus geeniksi
*Geeniaineksen siirto saman ja eri lajien eliöiden välillä
**Bakteerien konjugaatiot
**Endogeeniset retrovirukset
*Geenien kopioituminen ja sen jälkeine mutaatio ovat yleisiä tapahtumia
**Selittää molekyylien homologian eli esimerkiksi eri globiinilajien synnyn, esimerkiksi myoglobiinit ja eri hemoglobiinit ovat sukulaisia
*Limittäiset geenit
**Sama DNA-pätkä voi koodata kahta geeniä
*Neutraalit mutaatiot ja hyödylliset mutaatiot, esim DNA:n emässarjat GCC ja GCA [[geneettine molekyyli|koodaavat]] kumpikin samaa proteiinin aminohappo alaniinia
*Eliöiden, esimerkiksi bakteerien jakautuminen lisää hyödyllisten mutaation todennäköisyyttä, ja konjugaatoiot levittävät näitä mutaatioita
*Esisopeutuminen ja molekyylien funktioiden muutos: jokin tietty molekyylimuutos edeltää toista, esimerkiksi TTSS-eritysjärjestelmän kehittyminen edelsi bakteerimoottorin kehitystä
*Molekyylievoluutiota rajoittaa monesti muun muassa se, että monista proteiineista on suuri osa [[alfakierre]]ttä, johon sopivat vain tietyt aminohapot<ref>http://users.utu.fi/~jarnie/Biomolekyylit1.doc Biomolekyylit I</ref>.
== Molekyylievoluution nopeudesta ==
| 