GekasNkekas aloitti uransa kotimaassaan kakkosdivari joukkue [[AEL 1964]]:ssa. Kesällä [[2001]] kolmen AELissa vietetyn kauden jälkeen hän siirtyi [[Kallithea FC|Kallitheaan]]. Nkekasin hurjat maalimäärät liigassa herättivät Kreikan isojen seurojen kiinnostuksen. Tehtyään 46 maalia, 99:ssa ottelussa, siirtyi Gekas vuonna [[2005]] Panathinaikosiin.
Ensimmäisellä Panathinaikos-kaudellaan GekasNkekas jatkoi siitä mihin Kallitheassa jäi ja voitti liigan maalipörssin 17 maalilla. Maaliskuussa 2005 Nkekas teki debyyttinsä [[Kreikan jalkapallomaajoukkue|Kreikan maajoukkueessa]] MM-karsinta ottelussa [[Albanian jalkapallomaajoukkue|Albaniaa]] vastaan. Kreikka voitti ottelun 2–0. Ennen maajoukkue-esiintymistään Nkekas ei ollut koskaan aiemmin edustanut Kreikkaa edes nuorten maaotteluissa. Nkekas kuului myös Kreikan joukkueeseen vuoden [[2005 FIFA Confederations Cup|2005 Confederations Cupissa]]. Kaudella 2005/06 larissalainen sai kokemusta eurocup-peleistä, kun Panathinaikos pelasi [[mestarien liiga]]ssa.
Saksan toiseksi ylimmällä liigatasolla pelannut VfL Bochum halusi hankkia kreikkalaishyökkääjän jo keväällä [[2006]], mutta Panathinaikosin vaatima 1,5 miljoonan euron hinta Nkekasista oli liian suuri saksalaisjoukkueelle.