'''Sivuvaikutuksella''' tarkoitetaan lääketieteellisessä merkityksessään muuta kuin tavoiteltua vaikutusta. Sivuvaikutuksen saattaa laukaista lääkeaine, hoitomenetelmä tai -toimenpide. Sivuvaikutus mielletään usein kansanomaisesti haittavaikutukseksi. Sivuvaikutus voi olla odotettavissa, mutta hoitomenetelmästä saavutettu hyöty useimmiten kompensoi sivuvaikutuksen haitan.
Lääkeaineiden synnyttämistä yleisistä sivuvaikutuksista lääkäri pyrkii kertomaan määrätessään potilaalle lääkettä. Mikäli lääkkeen käytön aikana häiritseviä sivuvaikutuksia esiintyy, voidaan lääkeaine vaihtaa vastaavaan valmisteeseen lääkärin määräyksestä. Ihmisen reaktio tiettyihin lääkeaineisiin ja niiden sidosaineisiin ovat hyvin yksilölliset ja siksi kaikkia sivuvaikutuksia ei voida ennalta varmuudella tuntea. Esimerkkinä [[laktoosi|laktoosiin]] sidotun lääkeaineen määrääminen [[laktoosi-intoleranssi|laktoosi-intoleranssia]] sairastavalle potilaalle johtaa suurimmalla todennäköisyydellä sivuvaikutukseen, vaikka vaikuttava lääkeaine olisikin potilaan oireeseen oikea. Sivuvaikutukseen saattaa myös vaikuttaa toiset samanaikaisesti käytettävät lääkeaineet sekä niiden yhteisvaikutus. Sivuvaikutukset saattavat epäsopivan lääkeyhdistelyn ansiosta johtaa jopa kuolemaan.
