Valmistusmääräänsä nähden koneita on menetetty useita. Tähän voi olla osasyynä se, että konetyyppi on ollut hieman epävakaa ohjattava varsinkin huonoissa sääolosuhteissa. Tilanne on parantunut uusien ohjelmien ja koulutuksen avulla. Teknisesti konetyyppi on ollut kuitenkin suhteellisen luotettava. Konetyyppi on ollut mukana viidessä<ref name="Helsingin Sanomat">{{Verkkoviite| Osoite=http://www.hs.fi/ulkomaat/artikkeli/Rahtikone+syttyi+palamaan+maahansy%C3%B6ksyss%C3%A4+Tokiossa/1135244524172 | Nimeke = Rahtikone syttyi palamaan maahansyöksyssä Tokiossa | Julkaisija = Helsingin Sanomat}}</ref> sellaisessa onnettomuudessa, joissa on kuollut ihmisiä. Tuhoisin, 229 kuolonuhria vaatinut onnettomuus tapahtui 2. syyskuuta 1998, kun [[Swissair]]in MD-11 eli [[Swissairin lento 111|lento 111]] syöksyi mereen [[Halifax (Kanada)|Halifaxin]] edustalla. Onnettomuuden syynä oli koneeseen asennetun viihdejärjestelmän sähköjohdoista aiheutunut tulipalo. [[FedEx Expressin lennon 80 onnettomuus]] tapahtui [[Naritan kansainvälinen lentoasema|Naritan kansainvälisellä lentoasemalla]].<ref name="jtsb">{{Verkkoviite | Osoite = http://www.mlit.go.jp/jtsb/eng-air_report/N526FE.pdf | Nimeke = Aircraft accident investigation report - FedEx N526FE | Tekijä = | Tiedostomuoto = pdf | Selite = | Julkaisu = | Ajankohta = 26.4.2013 | Julkaisupaikka = | Julkaisija = JTSB | Viitattu = 28.5.2015 | Kieli = {{en}} }}</ref> Syynä oli se, että MD-11-kone ponnahti kentän pinnasta, kun perämies teki liian voimakkaan ohjausliikkeen. Tilanteessa vasempaan laskutelineeseen kohdistui voimakas isku. Liike-energia siirtyi laskutelineestä siipeen, joka murtui. Kone syttyi palamaan ja pyörähti ympäri. Sen kaksi lentäjää kuolivat.<ref name="jtsb" />
