Tulehduskipulääkkeillä on [[sivuvaikutus|sivuvaikutuksia]]. Ibuprofeeni ja aspiriini vahingoittavat ruoansulatuskanavaa. Noin 25 %:lle tulehduskipulääkkeiden pitkäaikaiskäyttäjistä kehittyy krooninen maha- tai pohjukkaissuolihaava. Suomessa arvioidaan 200–300150–400 ihmisen menehtyvän vuosittain tulehduskipulääkkeiden aiheuttamiin haittoihin.<ref>{{Verkkoviite | Osoite = http://www.kaypahoito.fi/kh/kaypahoito?suositus=khp00036 | Nimeke = Käyvän hoidon potilasversiot: Tulehduskipulääkkeet | Ajankohta = 11.3.2009| Julkaisija = Suomalainen Lääkäriseura Duodecim | Arkisto = https://web.archive.org/web/20070220212525/http://www.kaypahoito.fi/kh/kaypahoito?suositus=khp00036}}</ref><ref>{{Verkkoviite | Osoite = http://yle.fi/uutiset/fimea_kehottaa_malttiin_sarkylaakkeiden_kaytossa/6332646 | Nimeke = Fimea kehottaa malttiin särkylääkkeiden käytössä | Ajankohta = 12.10.2012| Julkaisija = YLE }}</ref><ref>[https://www.is.fi/terveys/art-2000000808210.html Särkylääkkeet syynä satoihin kuolemiin - tällä yhdellä tekijällä on iso merkitys!] Ilta-Sanomat 16.9.2014.</ref> Aspiriini hidastaa [[veren hyytyminen|veren hyytymistä]] ja lisää verenvuototaipumusta. Monet tulehduskipulääkkeet rasittavat maksaa. NSAID-tulehduskipulääkkeet on yhdistetty mm. suurentuneeseen sydänkohtausriskiin.
