Karussa ja happamassa [[humus|kangasmetsähumuksessa]] puolukka elää myös [[symbioosi|synnioossnissasasasasa]]ssa joidenkin sienten kanssa<ref name="otava"/>. Puolukkaan voivat iskeä myös erilaiset [[sienitauti|sienitaudit]]. Yleisimmät sienitaudit ovat [[pöhösieni|pöhösienten]] (''Exobasidium'' spp.) aiheuttamia, ja ne aiheuttavat puolukan lehtien turpoamista ja käpristymistä. Sieni valjastaa puolukan lehdet tällöin omien [[itiö]]idensä tuottamiseen, eivätkä ne enää sen jälkeen pysty yhteyttämään. ''[[Mycosphaerella rubefaciens]]'' -kotelosieni taas aiheuttaa lehtien värjäytymistä punaiseksi ja turpoamista. Toinen yleinen puolukassa esiintyvä sieni on myös harmaita laikkuja lehtien pintaan aiheuttava ''[[Mycosphaerella stemmatea]]''. ''[[Gibbera vaccinii]]'' -hiilipahkasieni aiheuttaa nokimaista, paksua karstaa. [[Härmäsieni|Härmäsienet]] ovat Suomessa harvinaisia, mutta mustikanruostesieni on yleinen. Suomessa esiintyy harvinaisena ruostesieni ''[[Calyptospora geoppertina]]'', joka muodostaa puolukan varressa talvi-itiöitään muuttaen sen paksuksi<ref name="weilingöös1994"/>.
