Ero sivun ”Protoklorofyllidi” versioiden välillä

[katsottu versio][katsottu versio]
Poistettu sisältö Lisätty sisältö
p typo, w
Aiheesta muualla ym
Rivi 12:
| smiles =
}}
'''Protoklorofyllidi''' (C<sub>35</sub>H<sub>32</sub>N<sub>4</sub>O<sub>5</sub><sub></sub>Mg) on [[porfyriinit|porfyriineihin]] kuuluva [[orgaaninen yhdiste]]. Yhdistettä esiintyy kasveissa ja yhteyttävissä bakteereissa ja se on välituote [[klorofylli]]n biosynteesissä[[biosynteesi]]ssä.
 
== Biosynteesi ja biologinen rooli ==
Protoklorofyllidin biosynteesin esiaste on monille porfyriineille tyypillisesti [[protoporfyriini IX]]. Tämä yhdiste sitoutuu [[koordinaatiosidos|koordinaatiosidoksilla]] [[magnesium]]ioniin ja tätä reaktiota katalysoi [[magnesiumkelataasi]]. Seuraavassa vaiheessa tästä kompleksista muodostuu monometyyliesteri. Seuraavia protoklorofyllidin biosynteesin vaiheita katalysoi eräs hapettava [[syklaasi]]entsyymi. Protoporfyriini IX:n magnesiumkompleksin monometyyliesteri hapettuu hapen vaikutuksesta ensin hydroksiesteriksi ja tämän jälkeen ketoesteriksi. Viimeisessä hapettavassa vaiheessa tämä ketoesteri syklitoituu, jolloin muodostuu klorofylleille tyypillinen viides isosyklinen rengas. Tämä tuote on divinyyliprotoklorofyllidi, joka pelkistetään protoklorofyllidiksi.<ref>{{Lehtiviite | Tekijä =David W. Bollivar & Samuel I. Beale | Otsikko =The Chlorophyll Biosynthetic Enzyme Mg-Protoporphyrin IX Monomethyl Ester (Oxidative) Cyclase | Julkaisu =Plant Physiology | Ajankohta =1996 | Vuosikerta =112 | Numero =1 | Sivut =105-114 | Julkaisupaikka = | Julkaisija = | Selite= | Tunniste= | www =http://www.plantphysiol.org/content/112/1/105.long | www-teksti = | Tiedostomuoto = | Viitattu =28.3.2017 | Kieli ={{en}} | Lopetusmerkki = }}</ref><ref name ="plant">{{Kirjaviite | Tekijä =Hans-Walter Heldt, Fiona Heldt | Nimeke =Plant biochemistry | Vuosi =2005 | Sivu =302 | Julkaisija =Academic Press | Tunniste =ISBN 978-0-12-088391-2 | www =https://books.google.fi/books?id=3DQQggoHy6YC&pg=PA302&dq=Protochlorophyllide&hl=fi&sa=X&redir_esc=y#v=onepage&q=Protochlorophyllide%20&f=false | www-teksti =Kirja Googlen teoshaussa | Viitattu =28.3.2017 | Kieli ={{en}}}}</ref>
 
Klorofyllin biosynteesin seuraavassa vaiheessa eräs protoklorofyllidin [[pyrroli]]renkaiden kaksoissidoksista pelkistetään ja tuotteeksi muodostuu klorofyllidiä. Pelkistimenä reaktiossa toimii [[Nikotiiniamidiadeniinidinukleotidifosfaatti|NADPH-molekyyli]]. Suurimmalla osilla kasveista tähän tarvitaan protoklorofyllidirduktaasi, joka aktivoituu valon vaikutuksesta. Sen sijaan monet [[levät]], [[bakteerit]], [[jäkälät]] ja eräät [[itiökasvit]] sisältävän valoaktivoidun entsyymin lisäksi myös pimeässä toimivaa entsyymiä. Protoklorofyllidi esiintyy osittain vapaana soluissa ja osittain sitoutuneena entsyymeihin. Vapaana olevan protoklorofyllidi voi katalysoida muun muassa soluja vahingoittavien happiradikaalien muodostumista. Kasvimutanttien, jotka tuottavat suuria määriä protoklorofyllidiä pimeässä on havaittu kuihtuvan, kun ne tuodaan valoon johtuen happiradikaalien muodostumisesta.<ref>{{Lehtiviite | Tekijä =Christiane Reinbothe, Majida El Bakkouri, Frank Buhr, Norifumi Muraki, Jiro Nomata, Genji Kurisu, Yuichi Fujita & Steffen Reinbothe | Otsikko =Chlorophyll biosynthesis: spotlight on protochlorophyllide reduction | Julkaisu =Trends in Plant Science | Ajankohta =2010 | Vuosikerta =15 | Numero =11 | Sivut =614–624 | Julkaisupaikka = | Julkaisija = | Selite= | Tunniste= | www =http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S136013851000155X | www-teksti = | Tiedostomuoto = | Viitattu =28.3.2017 | Kieli ={{en}} | Lopetusmerkki = }}</ref><ref name="handbook">{{Kirjaviite | Tekijä =Karl Kadish,Kevin M. Smith,Roger Guilard | Nimeke =The Porphyrin Handbook | Vuosi =2007 | Sivu =71-81 | Julkaisija =Elsevier | Tunniste =ISBN 978-0123932228 | www =https://books.google.fi/books?id=cpjWeethMHoC&pg=PA109&dq=Protochlorophyllide&hl=fi&sa=X&redir_esc=y#v=onepage&q=Protochlorophyllide&f=false | www-teksti =Kirja Googlen teoshaussa | Viitattu =28.3.2017 | Kieli ={{en}}}}</ref><ref>{{Kirjaviite | Tekijä =Lars Olof Björn | Nimeke =Photobiology | Vuosi =2015 | Sivu =94-95 | Julkaisija =Springer | Tunniste =ISBN 978-1-4939-1467-8 | www =https://books.google.fi/books?id=VDgLBgAAQBAJ&pg=PA94&dq=Protochlorophyllide&hl=fi&sa=X&redir_esc=y#v=onepage&q=Protochlorophyllide&f=false | www-teksti =Kirja Googlen teoshaussa | Viitattu =28.3.2017 | Kieli ={{en}}}}</ref><ref>{{Kirjaviite | Tekijä =Shain-Dow Kung,Shang-Fa Yang | Nimeke =Discoveries in Plant Biology | Vuosi =2000 | Sivu =86 | Julkaisija =World Scientific | Tunniste =ISBN 978-981-02-3882-7 | www =https://books.google.fi/books?id=ZACh8rueOSAC&pg=PA86&dq=Protochlorophyllide&hl=fi&sa=X&redir_esc=y#v=onepage&q=Protochlorophyllide&f=false | www-teksti =Kirja Googlen teoshaussa | Viitattu =28.3.2017 | Kieli ={{en}}}}</ref>
 
== Lähteet ==
{{Viitteet}}
 
== Aiheesta muualla ==
*[https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/compound/30123#section=Top PubChem: Protochlorophyllide a]
*[http://www.hmdb.ca/metabolites/HMDB31148 Human Metabolome Database (HMDB): Protochlorophyllide] {{en}}
*[http://www.genome.jp/dbget-bin/www_bget?C02880 Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG): Protochlorophyllide] {{en}}
 
[[Luokka:Biomolekyylit]]