Crozetsaaret löydettiinlöysi 22. tammikuuta 1772 ranskalaisen [[Marc-Joseph Marion du Fresne]]n johtamanjohtama retkikunnan toimestaretkikunta. Hänen tuttavansa, niin ikään ranskalainen [[Julien Crozet]] julisti kuitenkin virallisesti löytäneensä ne kaksi päivää myöhemmin.<ref name="s, 317" /> Myöhemmin saarille tuli hylkeenpyytäjiä, jotka saalistivat lähinnä merikarhuja. Metsästyksen takia merikarhut hävisivät saarilta lähes kokonaan vuoteen 1835 mennessä. Hylkeiden hävittyä niiden metsästys korvautui valaanpyynnillä. Sekä hylkeen- että valaanpyytäjien pääosa oli kotoisin [[Yhdysvallat|Yhdysvaltojen]] pohjoisosista, kuten esimerkiksi [[Massachusetts]]ista. Saarilla kävi silloin tällöin myös lähistölle haaksirikkoutuneiden laivojen miehistöjä. Haaksirikoista tuli niin yleisiä, että [[Royal Navy]] alkoi järjestää parin vuoden välein saarille pelastusoperaatioita. Ranskalaiset viranomaiset kiinnostuivat saarista 1800-luvun lopulla ja 1900-luvun alussa järjestäen matkoja saarille Ranskan hallinnon tukemiseksi. Crozetsaaria hallinnoitiin aluksi [[Madagaskar]]in osana, mutta niistä tuli osa ''Terres Australes and Antarctiques Françaisesia'' eli [[Ranskan eteläiset ja antarktiset alueet|Ranskan eteläisiä ja antarktisia alueita]] vuonna 1955. Ensimmäinen väliaikainen tieteelinen asema perustettiin Île de la Possessionlle vuonna 1961. 1963-1964 perustettiin Alfred-Fauren asema, jossa on nykyisin talvien yli 35 henkilöä. Asemaan kuuluu myös postitoimisto ja kirkko. Ylikalastuksen estämiseksi [[Ranskan laivasto]] partioi alueen vesiä.<ref name="Discover France" />
