EC-numero koostuu Tunnuksesta EC ja neljästä luvusta, jotka erotetaan toisitaan pisteillä. Ensimmäinen numero kertoo pääluokan, johon entsyymi kuuluu ja minkätyyppistä reaktiota se katalysoi. Toinen Numeronumero kertoo alaluokan ja lisätietoa reaktiosta. Kolmas numero antaa lisätietoa reaktiosta ja neljäs numero kertoo substraattispesifisyyden.<ref name="Biochemistry" /><ref name="classification" /><ref>{{Kirjaviite | Tekijä =Torsten Schwede,Manuel Claude Peitsch | Nimeke =Computational structural biology | Vuosi =2008 | Sivu =193 |Julkaisija =World Scientific | Tunniste =ISBN 978-981-277-877-2 | www =http://books.google.fi/books?id=aZLpHRteWtIC&pg=PA192&dq=EC+number&hl=fi&ei=-QkcTtjqEsn5sgac782WBw&sa=X&oi=book_result&ct=result&resnum=6&ved=0CEUQ6AEwBTgK#v=onepage&q=EC%20number&f=false | www-teksti =Kirja Googlen teoshaussa | Viitattu = 12.07.2011 | Kieli ={{en}}}}</ref>
