'''Synnynnäinen sairaus''' tai '''synnynnäinen vaiva''' on haitallinen tila, jonka henkilöllä on hänen [[Synnytys|syntyessään]] tai kehittyy ensimmäisen elinkuukauden aikana ilman selvää ulkoista vaikutusta. Synnynnäiset sairaudet kehittyvät yleensä jo ennen syntymää. Rakenteellisia synnyinnäisiäsynnynnäisiä sairauksia kutsutaan synnynnäisiksi anomalioiksi.{{lähde|Käännösvirhe?}} Synnynnäisiksi sairauksiksi ei luokitella [[sikiö]]n vaurioita, jotka aiheutuvat ulkoisista seikoista.
SynnyinäsetSynnynnäiset vaivat voivat johtua [[Perinnöllinen sairaus|geenivirheestä]], kohdunsisäisestä ympäristöstä, elinten [[morfogeneesi]]n virheestä, [[infektio]]sta tai [[kromosomi|kromosomaalisesta]] virheestä. Vaivan vakavuus riippuu raskauden aikaisen ja jälkeisen tilojen välisestä monimutkaisesta vuorovaikutuksesta.<ref name="cdc">[http://www.cdc.gov/ncbddd/bd/research.htm Birth Defects Research]. Centers for Disease Control and Prevention.</ref> Tutkimukset eläimillä osoittavat, että äidin (ja mahdollisesti isänkin) ruokavaliolla, vitamiineilla, glukoosin saannilla jo ennen ovulaatiolla ja raskautta on vaikutus sikion kehitykseen, kasvuun ja mahdollisiin vaivoihin.<ref>{{Verkkoviite | Osoite =http://www.consultantlive.com/display/article/10162/1532211 | Nimeke =Pre-Prenatal Care: A Primary Care Primer on the Future | Tekijä =Gregory W. Rutecki | Tiedostomuoto = | Selite = | Julkaisu =ConsultantLive.com | Ajankohta = | Julkaisupaikka = | Julkaisija = | Viitattu = 25.10.2010 | Kieli = }}</ref> SynnynäistäSynnynnäistä sairautta aiheuttavaa ulkoista ainetta kutsutaan [[Teratogeneesi|teratogeeniksi]].