Ero sivun ”Rubisco” versioiden välillä
| [katsottu versio] | [katsottu versio] |
Poistettu sisältö Lisätty sisältö
kuva ja viitteiden säätöä |
Ei muokkausyhteenvetoa |
||
Rivi 22:
==Mekanismi==
Jotta rubisco toimisi katalyyttisesti aktiivisena entsyyminä, entsyymin säätelykohdassa sijaitsevan [[lysiini]]aminohapon sivuketjun aminoryhmään täytyy liittyä hiilidioksidi, jolloin muodostuu [[Karbamaatit|karbamaattiryhmä]], joka sitoutuu [[koentsyymi]]nä toimivaan [[magnesium]]ioniin. Entsyymin substraatti ribuloosi-1,5-bisfosfaatti sitoutuu kuitenkin hyvin voimakkaasti tähän sivuketjuun ja estää rubiscon täydellisen toiminnan. Tämän vuoksi toinen entsyymi [[rubiscoaktivaasi]] irrottaa ribuloosi-1,5-bisfosfaatin [[ATP|ATP:tä]] kuluttavalla reaktiolla, ja näin sivuketjun karboksylaatio pääsee tapahtumaan ja entsyymin konformaatio muuttuu aktiiviseksi. Rubiscoaktivaasi on siis säätelyproteiini.<ref name="Biochemistry" /><ref name="herbicides" /><ref name ="GG">
Ribuloosi-1,5-bisfosfaatti sitoutuu magnesiumioniin ketoryhmänsä ja sen viereisessä hiilessä olevan [[hydroksyyli]]ryhmän välityksellä. Magnesiumioni on sitoutunut [[lysiini]]n karbamaattiryhmän lisäksi myös entsyymin [[asparagiinihappo|asparagiini]]- ja [[glutamiinihappo]]jen sivuketjuihin. Lysiinin aminoryhmä poistaa substraatilta protonin, jolloin muodostuu [[enoli|enediolaatti]]välituote. Protoninsiirron seurauksena enediolaatti isomerisoituu toiseksi enediolaatiksi, johon rubisco liittää [[nukleofiili]]sellä additioreaktiolla hiilidioksidin, jolloin muodostuu 2-karboksi-3-keto-{{sc|d}}-arabinitoli-1,5-bisfosfaattia. Tämä on hyvin pysymätön välituote, johon liittyy vesimolekyyli ja muodostuu hydroksi-β-ketohappo. Tämä hajoaa 3-fosfoglyseraatiksi [[aldolikondensaatio]]n käänteisreaktiolla.<ref name="Biochemistry" /><ref name="organic">{{Kirjaviite | Tekijä =John McMurry, Tadhg P. Begley | Nimeke =The organic chemistry of biological pathways | Sivu = 213 | Vuosi =2005 | Julkaisija =Roberts and Company Publishers | Tunniste =ISBN 978-0974707716 | www =http://books.google.fi/books?id=slpol42h5D4C | www-teksti =Kirja Googlen teoshaussa | Kieli ={{en}}}}</ref>
| |||