Ero sivun ”Sitraattisyntaasi” versioiden välillä
| [arvioimaton versio] | [katsottu versio] |
Poistettu sisältö Lisätty sisältö
p r2.7.1) (Botti lisäsi: zh:柠檬酸合酶 |
|||
Rivi 3:
==Rakenne ja mekanismi==
Sitraattisyntaasi esiintyy eliöiden soluissa [[mitokondrio]]iden matriisissa. Nisäkkäillä entsyymi on [[dimeeri]] eli koostuu kahdesta yksiköstä, jotka ovat keskenään samanlaisia. Kooltaan yksiköt ovat 49 [[Dalton|kDa]]. Eräillä muilla eliöillä entsyymi voi koostua kuudesta yksiköstä, jolloin se on heksameeri.<ref name="Biochemistry" /><ref name="MM">{{Kirjaviite | Tekijä =David E. Metzler,Carol M. Metzler | Nimeke =Biochemistry: the chemical reactions of living cells | Vuosi =2001 | Sivu =701 | Julkaisija =Academic Press | Tunniste =ISBN 978-0-12-492540-3 | www =http://books.google.fi/books?id=v9HL5VyRmZcC&pg=PA701&dq=Citrate+synthase&hl=fi&ei=PwwwTtfnKpDNswbLx7HxDw&sa=X&oi=book_result&ct=result&resnum=10&ved=0CFgQ6AEwCTgU#v=onepage&q=Citrate%20synthase&f=false | www-teksti =Kirja Googlen teoshaussa | Viitattu = 27.07.2011 | Kieli ={{en}}}}</ref><ref name="Mitochondria">{{Kirjaviite | Tekijä =Liza A. Pon,Eric A. Schon | Nimeke =Mitochondria | Vuosi =2007 | Sivu =207 | Julkaisija =Academic Press | Tunniste =ISBN 9780125441735 | www =http://books.google.fi/books?id=dYKC0YyqKhMC&pg=PA207&dq=Citrate+synthase&hl=fi&ei=-gswTueaFIO6-Aa8qvmJBA&sa=X&oi=book_result&ct=result&resnum=1&ved=0CCcQ6AEwADgK#v=onepage&q=Citrate%20synthase&f=false | www-teksti =Kirja Googlen teoshaussa | Viitattu = 27.07.2011 | Kieli ={{en}}}}</ref>
Oksaalietikkahappo sitoutuu avoimeen inaktiivseen entsyymiin. Sitoutumisen seurauksena entsyymin konformaatio muuttuu, alayksiköt siirtyvät lähemmäs toisiaan noin 15 [[Ångström|Å]]:n verran. Kummassakin yksikössä on myös pienempi alayksikkö joka pyörähtää 19 astetta. Tällöin sitraattisyntaasiin muodostuu sitoutumiskohta myös koentsyymi-A:lle. Sitraattisyntaasi tuo substraatit lähelle toisiaan, asettaa ne oikeaan asemaan ja polarisoi eräitä sidoksia. Aktiivisessa kohdassa [[asparagiinihappo]] toimii emäksenä ja poistaa asetyylikoentsyymi-A:n hiiliatomilta protonin ja [[histidiini]] luovuttaa protonin asetyylikoentsyymi-A:n karbonyyliryhmän hapelle, jolloin muodostuu [[enoli]]. Toinen histidiini aktivoi oksaloasetaattimolekyylin luovuttamalla sen karbonyyliryhmälle protonin. Enolisoitunut asetyylikoentsyymi-A on nukelofiili ja hyökkää oksaloetikkahappoon, reaktio on tyypiltään [[adolikondensaatio]]. Näin muodostuu välituotteena sitryylikoentsyymi-A. Hydrolyysin jälkeen sitruunahappo- ja koentsyymi-A-nolekyylit vapautuvat entsyymistä.<ref name="Biochemistry" /><ref name="organic">{{Kirjaviite | Tekijä =John McMurry,Tadhg P. Begley | Nimeke =The organic chemistry of biological pathways | Vuosi =2005 | Sivu =187 | Julkaisija =Roberts and Company Publishers | Tunniste =ISBN 978-0974707716 | www =http://books.google.fi/books?id=slpol42h5D4C&pg=PA187&dq=Citrate+synthase&hl=fi&ei=tD4tTuGxD4XCswbHvq33Dw&sa=X&oi=book_result&ct=result&resnum=6&ved=0CD0Q6AEwBTg8#v=onepage&q=Citrate%20synthase&f=false | www-teksti =Kirja Googlen teoshaussa | Viitattu =27.7.2011 | Kieli ={{en}}}}</ref>
| |||