Kuoppapyydys on eläintieteilijöiden apuväline, jolla pyydystetään pääasiassa hämähäkkejä ja kovakuoriaisia. Tavallisesti se on muovinen purkki, kooltaan esimerkiksi 15 × 10 cm, joka asetetaan maahan kaivettuun kuoppaan siten, että avoimen purkin yläreunat ovat tarkalleen maan pinnan tasalla. Purkissa on veden ja etyleeniglykolin muodostama liuos, johon on pintajännitteen poistamiseksi lisätty esimerkiksi tiskiainetta. Purkin kanneksi asetetaan tappien varaan esimerkiksi peltilevy, joka estää sadeveden pääsyn purkkiin. Jos tutkimusalue on sellaisessa paikassa, missä liikkuu isompia eläimiä, kuten karjaa, hevosia tai ihmisiä, purkit on syytä suojata vaikkapa lankuista tehdyillä polkaisusuojilla.

Esimerkki kuoppapyydyksestä. Pyydyspurkin päällä oleva levy on paitsi merkki pyydyksen paikasta, myös sateensuoja.

Pyydys toimii siten, että pyydystettävät eläimet putoavat liuokseen ja kuolevat välittömästi. Toisinaan pyydykseen molskahtaa sellaisiakin eläimiä, joita ei ole tarkoitus tappaa, kuten pieniä sammakoita ja sisiliskoja. Kuoppapyydyksiä käytetään, kun halutaan tutkia jonkin pienehkön alan eläimistöä. Pyydyksiä on oltava laskennallisesti oikea määrä, ne on koettava säännöllisin väliajoin ja sisältö on aina koettaessa tyhjennettävä ja saalis tilastoitava. Uutta liuosta lisätään tyhjennyksen jälkeen. Menetelmän avulla saadaan suhteellisen luotettava kuva tutkimusalueen eräistä eliöistä.